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Daño de los radicales libres al ADN

El daño de los radicales libres al ADN puede ocurrir como resultado de la exposición a radiaciones ionizantes o a compuestos radiomiméticos [1] . El daño al ADN como resultado del ataque de los radicales libres se denomina daño indirecto del ADN porque los radicales formados pueden difundirse por todo el cuerpo y afectar otros órganos. El melanoma maligno puede ser causado por daño indirecto al ADN porque se encuentra en partes del cuerpo no expuestas a la luz solar. El ADN es vulnerable al ataque de los radicales debido a los hidrógenos muy lábiles que pueden extraerse y a la prevalencia de dobles enlaces en las bases del ADN a los que los radicales libres pueden añadir fácilmente . [2]

Daños por exposición a la radiación.

La radiólisis del agua intracelular mediante radiación ionizante crea peróxidos , que son precursores relativamente estables de los radicales hidroxilo . Entre el 60% y el 70% del daño del ADN celular es causado por radicales hidroxilo, [3] sin embargo, los radicales hidroxilo son tan reactivos que solo pueden difundir uno o dos diámetros moleculares antes de reaccionar con los componentes celulares. Por tanto, para poder reaccionar deben formarse radicales hidroxilo inmediatamente adyacentes a los ácidos nucleicos . La radiólisis del agua crea peróxidos que pueden actuar como formas latentes y difusos de radicales hidroxilo. Algunos iones metálicos cercanos al ADN generan radicales hidroxilo a partir del peróxido. [4]

H 2 O + → H 2 O + + mi
H 2 O + mi - → H 2 O -
H 2 O + → H + + OH ·
H 2 O → OH + H ·
2 OH · →H 2 O 2

Se cree que el daño de los radicales libres al ADN causa mutaciones que pueden provocar algunos cánceres.

La reacción de Fenton

La reacción de Fenton da como resultado la creación de radicales hidroxilo a partir de peróxido de hidrógeno y un catalizador de hierro (II). El hierro (III) se regenera mediante la reacción de Haber-Weiss . Los metales de transición con un sitio de coordinación libre son capaces de reducir los peróxidos a radicales hidroxilo. [1] Se cree que el hierro es el metal responsable de la creación de radicales hidroxilo porque existe en la concentración más alta de cualquier metal de transición en la mayoría de los organismos vivos. [5] La reacción de Fenton es posible porque los metales de transición pueden existir en más de un estado de oxidación y sus electrones de valencia pueden estar desapareados, lo que les permite participar en reacciones redox de un electrón.

Fe 2+ + H 2 O 2 → Fe 3+ + OH · + OH

La creación de radicales hidroxilo mediante catálisis de hierro (II) es importante porque el hierro (II) se puede encontrar coordinado con el ADN y, por lo tanto, muy cerca de él. Esta reacción permite que el peróxido de hidrógeno creado por la radiólisis del agua se difunda hacia el núcleo y reaccione con el hierro (II) para producir radicales hidroxilo, que a su vez reaccionan con el ADN. La ubicación y unión del hierro (II) al ADN puede desempeñar un papel importante en la determinación del sustrato y la naturaleza del ataque radical al ADN. La reacción de Fenton genera dos tipos de oxidantes, Tipo I y Tipo II. Los oxidantes tipo I son moderadamente sensibles a los peróxidos y al etanol. [5] Los oxidantes de tipo I y tipo II se escinden preferentemente en secuencias específicas. [5]

Ataque radical hidroxilo

Los ataques radicales de hidroxilo pueden formar sitios sin fundamento

Los radicales hidroxilo pueden atacar la columna vertebral y las bases del ADN de desoxirribosa, causando potencialmente una gran cantidad de lesiones que pueden ser citotóxicas o mutagénicas . Las células han desarrollado mecanismos de reparación complejos y eficientes para reparar las lesiones. En el caso del ataque de radicales libres al ADN, el mecanismo de reparación utilizado es la reparación por escisión de bases . Las reacciones de los radicales hidroxilo con la estructura principal del azúcar desoxirribosa se inician mediante la extracción de hidrógeno de un carbono de desoxirribosa, y la consecuencia predominante es la eventual rotura de la cadena y la liberación de bases. El radical hidroxilo reacciona con los distintos átomos de hidrógeno de la desoxirribosa en el orden 5′ H > 4′ H > 3′ H ≈ 2′ H ≈ 1′ H. Este orden de reactividad es paralelo a la exposición al disolvente de los hidrógenos de la desoxirribosa. [6]

Los radicales hidroxilo reaccionan con las bases del ADN mediante la adición de enlaces pi ricos en electrones. Estos enlaces pi en las bases se ubican entre C5-C6 de las pirimidinas y N7-C8 en las purinas . [7] Tras la adición del radical hidroxilo, se pueden formar muchos productos estables. En general, los ataques de radicales hidroxilo a las bases no provocan azúcares alterados ni roturas de hebras, excepto cuando las modificaciones tabilizan el enlace N-glicosilo, permitiendo la formación de sitios sin base que están sujetos a eliminación beta.

Sitios abásicos

Ruta de formación de desoxirribonolactona.

La extracción de hidrógeno del carbono 1'-desoxirribosa por el radical hidroxilo crea un radical 1'-desoxirribosilo. Luego, el radical puede reaccionar con el oxígeno molecular, creando un radical peroxilo que puede reducirse y deshidratarse para producir una 2'-desoxirribonolactona y una base libre. Una desoxirribonolactona es mutagénica y resistente a las enzimas reparadoras. Así, se crea un sitio abásico. [8]

Daño radical por compuestos radiomiméticos

El daño radical al ADN también puede ocurrir a través de la interacción del ADN con ciertos productos naturales conocidos como compuestos radiomiméticos, compuestos moleculares que afectan el ADN de manera similar a la exposición a la radiación. Los compuestos radiomiméticos inducen roturas de doble cadena en el ADN mediante ataques concertados y altamente específicos de radicales libres contra los restos de desoxirribosa en ambas cadenas de ADN.

Mecanismo general

Muchos compuestos radiomiméticos son enediinas , que sufren la reacción de ciclación de Bergman para producir un diradical 1,4-dideshidrobenceno . El diradical 1,4-dideshidrobenceno es altamente reactivo y extraerá hidrógenos de cualquier posible donante de hidrógeno.

generación de p-bencino a partir de un enediino

En presencia de ADN, el diradical 1,4-dideshidrobenceno extrae hidrógenos de la cadena principal del azúcar desoxirribosa, predominantemente en las posiciones C-1', C-4' y C-5'. La extracción de hidrógeno provoca la formación de radicales en el carbono reaccionado. El radical de carbono reacciona con el oxígeno molecular, lo que provoca una rotura de la cadena del ADN a través de diversos mecanismos. [9] El 1,4-dideshidrobenceno es capaz de posicionarse de tal manera que puede extraer hidrógenos proximales de ambas hebras de ADN. [10] Esto produce una rotura de doble hebra en el ADN, que puede provocar apoptosis celular si no se repara.

Los enediynes generalmente sufren la ciclación de Bergman a temperaturas superiores a 200 °C. Sin embargo, la incorporación de la enediina en un hidrocarburo cíclico de 10 miembros hace que la reacción sea más termodinámicamente favorable al liberar la tensión del anillo de los reactivos. Esto permite que la ciclación de Bergman se produzca a 37 °C, la temperatura biológica de los humanos. Se ha descubierto que las moléculas que incorporan enediinas en estas estructuras anulares más grandes son extremadamente citotóxicas . [11]

Productos naturales

Los enediynes están presentes en muchos productos naturales complicados. Fueron descubiertos originalmente a principios de la década de 1980 durante la búsqueda de nuevos productos anticancerígenos producidos por microorganismos. [10] La caliqueamicina fue uno de los primeros productos identificados y se encontró originalmente en una muestra de suelo tomada de Kerrville, Texas. Estos compuestos son sintetizados por bacterias como mecanismos de defensa debido a su capacidad para escindir el ADN mediante la formación de 1,4-dideshidrobenceno a partir del componente enediino de la molécula.

La caliqueamicina y otros compuestos relacionados comparten varias características comunes. Las estructuras extendidas unidas a la enediina permiten que el compuesto se una específicamente al ADN, [12] en la mayoría de los casos al surco menor de la doble hélice. Además, parte de la molécula se conoce como “gatillo” que, en condiciones fisiológicas específicas, activa la enediina, conocida como “ojiva” y se genera 1,4-dideshidrobenceno.

Desde entonces se han identificado tres clases de enediinas: caliqueamicina, dinamicina y productos a base de cromoproteínas .

Los tipos de caliqueamicina se definen por un grupo trisulfuro de metilo que participa en la activación de la molécula mediante el siguiente mecanismo. [10]

Mecanismo de acción de la caliqueamicina

La caliqueamicina y la esperamicina, estrechamente relacionada, se han utilizado como fármacos anticancerígenos debido a su alta toxicidad y especificidad. [10]

La dinemicina y sus parientes se caracterizan por la presencia de un núcleo de antraquinona y enediino. El componente antraquinona permite la unión específica del ADN en el lado 3' de las bases purínicas mediante intercalación , un sitio que es diferente de la caliqueamicina. Su capacidad para escindir el ADN aumenta considerablemente en presencia de NADPH y compuestos de tiol . [13] Este compuesto también ha encontrado prominencia como agente antitumoral. [13]

Las cromoproteínas enediinas se caracterizan por un cromóforo inestable unido a una apoproteína .

Escisión del ADN causada por la cromoproteína C-1027.

El cromóforo no reacciona cuando se une a la apoproteína. Tras su liberación, reacciona para formar 1,4-dideshidrobenceno y posteriormente escinde el ADN.

Capacidad antitumoral

La mayoría de los enediinos, incluidos los enumerados anteriormente, se han utilizado como potentes antibióticos antitumorales debido a su capacidad para escindir el ADN de manera eficiente. La caliqueamicina y la esperamicina son los dos tipos más utilizados debido a su alta especificidad al unirse al ADN, lo que minimiza las reacciones secundarias desfavorables. [12] Se ha demostrado que son especialmente útiles para tratar la leucemia mieloide aguda . [14]

Además, la caliqueamicina es capaz de escindir el ADN en bajas concentraciones, demostrando ser hasta 1000 veces más eficaz que la adriamicina para combatir ciertos tipos de tumores. [15]

El mecanismo de los radicales libres para tratar ciertos tipos de cánceres se extiende más allá de los enediynes. La tirapazamina genera un radical libre en condiciones anóxicas en lugar del mecanismo desencadenante de una enediina. Luego, el radical libre continúa escindiendo el ADN de manera similar al 1,4-dideshidrobenceno para tratar las células cancerosas. Actualmente se encuentra en ensayos de Fase III.

Evolución de la meiosis

La meiosis es una característica central de la reproducción sexual en eucariotas . Se ha planteado la hipótesis de que la necesidad de reparar el daño oxidativo del ADN causado por los radicales libres oxidativos es una fuerza impulsora importante en la evolución de la meiosis [16] [17]

Referencias

  1. ^ ab Barbusinski K (2009). "Reacción de Fenton: controversia sobre la química". Química e Ingeniería Ecológica . 16 (3).
  2. ^ Greenberg MM (2016). "Reactividad de los radicales de ácidos nucleicos". Avances en Química Física Orgánica . 50 . Elsevier: 119-202. doi :10.1016/bs.apoc.2016.02.001. ISBN 978-0-12-804716-3. PMC  5435387 . PMID  28529390.
  3. ^ Sala JF (1988). Daño en el ADN producido por radiaciones ionizantes en células de mamíferos: identidades, mecanismos de formación y reparabilidad . Avances en la investigación de ácidos nucleicos y biología molecular. vol. 35. págs. 95-125. doi :10.1016/s0079-6603(08)60611-x. ISBN 9780125400350. PMID  3065826.
  4. ^ Henle ES, Linn S (agosto de 1997). "Formación, prevención y reparación del daño del ADN por peróxido de hierro/hidrógeno". La Revista de Química Biológica . 272 (31): 19095–8. doi : 10.1074/jbc.272.31.19095 . PMID  9235895. S2CID  11016259.
  5. ^ abc Pogozelski WK, Tullius TD (mayo de 1998). "Escisión oxidativa de la hebra de ácidos nucleicos: rutas iniciadas por la abstracción de hidrógeno de la fracción de azúcar". Reseñas químicas . 98 (3): 1089-1108. doi :10.1021/cr960437i. PMID  11848926.
  6. ^ Balasubramanian B, Pogozelski WK, Tullius TD (agosto de 1998). "La rotura de la cadena de ADN por el radical hidroxilo está gobernada por las áreas de superficie accesibles de los átomos de hidrógeno de la columna vertebral del ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (17): 9738–43. Código bibliográfico : 1998PNAS...95.9738B. doi : 10.1073/pnas.95.17.9738 . PMC 21406 . PMID  9707545. 
  7. ^ SteenkenS (1989). "Bases purínicas, nucleósidos y nucleótidos: química redox en solución acuosa y reacciones de transformación de sus cationes radicales y aductos e- y OH". Química. Rdo . 89 (3): 503–529. doi :10.1021/cr00093a003.
  8. ^ Lhomme J, Constant JF, Demeunynck M (1999). "Estructura, reactividad y reconocimiento básico del ADN". Biopolímeros . 52 (2): 65–83. doi :10.1002/1097-0282(1999)52:2<65::aid-bip1>3.3.co;2-l. PMID  10898853.
  9. ^ Povirk LF (1996). "Daño del ADN y mutagénesis por agentes radiomiméticos que escinden el ADN: bleomicina, neocarzinostatina y otras enediinas". Investigación de mutaciones/Mecanismos fundamentales y moleculares de la mutagénesis . 355 (1–2): 71–89. doi :10.1016/0027-5107(96)00023-1. PMID  8781578.
  10. ^ abcd Kraka E, Cremer D (2000). "Diseño informático de fármacos contra el cáncer. Una nueva ojiva enediyne". Mermelada. Química. Soc . 122 (34): 8245–8264. doi :10.1021/ja001017k.
  11. ^ Zhen YS, Ming XY, Yu B, Otani T, Saito H, Yamada Y (agosto de 1989). "Un nuevo antibiótico antitumoral macromolecular, C-1027. III. Actividad antitumoral". La revista de antibióticos . 42 (8): 1294–8. doi : 10.7164/antibióticos.42.1294 . PMID  2759910.
  12. ^ ab Ellestad GA (septiembre de 2011). "Características estructurales y conformacionales relevantes para la actividad antitumoral de la caliqueamicina γ 1I". Quiralidad . 23 (8): 660–71. doi :10.1002/chir.20990. PMID  21800378.
  13. ^ ab Sugiura Y, Shiraki T, Konishi M, Oki T (mayo de 1990). "Intercalación y escisión de ADN de un antibiótico antitumoral dinemicina que contiene núcleos de antraciclina y enediyne". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 87 (10): 3831–5. Código bibliográfico : 1990PNAS...87.3831S. doi : 10.1073/pnas.87.10.3831 . PMC 53997 . PMID  2339123. 
  14. ^ Sievers EL, Appelbaum FR, Spielberger RT, Forman SJ, Flowers D, Smith FO, Shannon-Dorcy K, Berger MS, Bernstein ID (junio de 1999). "Ablación selectiva de la leucemia mieloide aguda mediante quimioterapia dirigida a anticuerpos: un estudio de fase I de un inmunoconjugado de caliqueamicina anti-CD33". Sangre . 93 (11): 3678–84. doi :10.1182/sangre.V93.11.3678. PMID  10339474.
  15. ^ Zein N, Sinha AM, McGahren WJ, Ellestad GA (mayo de 1988). "Caliqueamicina gamma 1I: un antibiótico antitumoral que escinde específicamente el sitio del ADN bicatenario". Ciencia . 240 (4856): 1198–201. Código Bib : 1988 Ciencia... 240.1198Z. doi : 10.1126/ciencia.3240341. PMID  3240341.
  16. ^ Hörandl E, Hadacek F. La hipótesis de iniciación del daño oxidativo para la meiosis. Reproducción de plantas. 2013 diciembre;26(4):351-67. doi: 10.1007/s00497-013-0234-7. Publicación electrónica del 31 de agosto de 2013. PMID 23995700; PMCID: PMC3825497
  17. ^ Hörandl E, Speijer D. Cómo el oxígeno dio lugar al sexo eucariota. Proc Biol Ciencia. 285(1872):20172706. doi: 10.1098/rspb.2017.2706. PMID 29436502; PMCID: PMC5829205