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Ciclo de Krebs inverso

El ciclo de TCA reductivo/inverso (ciclo rTCA). Se muestran todos los reactivos, intermedios y productos de este ciclo.

El ciclo inverso de Krebs (también conocido como ciclo inverso del ácido tricarboxílico , ciclo inverso del TCA , o ciclo inverso del ácido cítrico , o ciclo reductor del ácido tricarboxílico , o ciclo reductivo del TCA ) es una secuencia de reacciones químicas que son utilizadas por algunos bacterias para producir compuestos de carbono a partir de dióxido de carbono y agua mediante el uso de agentes reductores ricos en energía como donantes de electrones.

La reacción es el ciclo del ácido cítrico que se ejecuta a la inversa. Mientras que el ciclo de Krebs toma carbohidratos y los oxida a CO 2 y agua, el ciclo inverso toma CO 2 y H 2 O para formar compuestos de carbono. Este proceso es utilizado por algunas bacterias (como Aquificota ) para sintetizar compuestos de carbono, utilizando en ocasiones hidrógeno , sulfuro o tiosulfato como donadores de electrones . [1] [2] Este proceso puede verse como una alternativa a la fijación de carbono inorgánico en el ciclo reductor de las pentosas fosfato que ocurre en una amplia variedad de microbios y organismos superiores.

Diferencias con el ciclo de Krebs

A diferencia del ciclo oxidativo del ácido cítrico, el ciclo inverso o reductivo tiene algunas diferencias clave. Hay tres enzimas específicas del ciclo reductor del ácido cítrico: citrato liasa , fumarato reductasa y α-cetoglutarato sintasa. [ cita necesaria ]

La división del ácido cítrico en oxaloacetato y acetato está catalizada por la citrato liasa , en lugar de la reacción inversa de la citrato sintasa . [3] La succinato deshidrogenasa se reemplaza por la fumarato reductasa y la α-cetoglutarato sintasa reemplaza a la α-cetoglutarato deshidrogenasa . [ cita necesaria ]

La conversión de succinato en 2-oxoglutarato también es diferente. En la reacción oxidativa este paso va acoplado a la reducción de NADH . Sin embargo, la oxidación del 2-oxoglutarato a succinato es tan energéticamente favorable que el NADH carece del poder reductor para impulsar la reacción inversa. En el ciclo rTCA, esta reacción tiene que utilizar una ferredoxina reducida de bajo potencial . [4]

Relevancia para la vida temprana

La reacción es un posible candidato a las condiciones prebióticas de la Tierra primitiva y, por tanto, es de interés en la investigación del origen de la vida . Se ha descubierto que algunos pasos no consecutivos del ciclo pueden ser catalizados por minerales a través de la fotoquímica , [5] mientras que secuencias completas de dos y tres pasos pueden ser promovidas por iones metálicos como el hierro (como agentes reductores ) en condiciones ácidas . Además, estos organismos que se someten a fotoquímica pueden utilizar y utilizan el ciclo del ácido cítrico. [1] Sin embargo, las condiciones son extremadamente duras y requieren ácido clorhídrico 1 M o ácido sulfúrico 1 M y un fuerte calentamiento a 80-140 °C. [6]

Junto con estas posibilidades de que el ciclo de rTCA contribuya a la vida temprana y a las biomoléculas , se cree que el ciclo de rTCA no podría haberse completado sin el uso de enzimas. Los parámetros cinéticos y termodinámicos de la reducción de especies altamente oxidadas para impulsar el ciclo rTCA son aparentemente improbables sin la acción necesaria de catalizadores biológicos conocidos como enzimas . La velocidad de algunas de las reacciones en el ciclo rTCA probablemente habría sido demasiado lenta para contribuir significativamente a la formación de vida en la Tierra sin enzimas. Teniendo en cuenta la termodinámica del ciclo rTCA, el aumento de la energía libre de Gibbs que pasa del producto al reactivo haría del pirofosfato una fuente de energía poco probable para la conversión de piruvato en oxalacetato, ya que la reacción es demasiado endoérgica . [7] Sin embargo, se sugiere que podría haberse originado un precursor no enzimático del ciclo de Krebs, el ciclo del glioxilato y el ciclo de Krebs inverso, donde cooperaron reacciones de oxidación y reducción. El uso posterior de la carboxilación utilizando ATP podría haber dado lugar a partes del ciclo de Krebs inverso. [8]

Se sugiere que el ciclo inverso de Krebs fue incompleto, incluso en el último ancestro común universal . [9] [10] Muchas reacciones del ciclo inverso de Krebs, incluidas la tioesterificación y la hidrólisis, podrían haber sido catalizadas por minerales de sulfuro de hierro en cavidades de respiraderos hidrotermales alcalinos de aguas profundas. [11] Más recientemente, se ha demostrado que las microgotas acuosas promueven reacciones de carboxilación reductora en el ciclo de Krebs inverso. [12]

Relevancia médica

Se propone que el ciclo de Krebs inverso tenga un papel importante en la fisiopatología del melanoma . Se sabe que los tumores de melanoma alteran las vías metabólicas normales para utilizar productos de desecho. Estas adaptaciones metabólicas ayudan al tumor a adaptarse a sus necesidades metabólicas. La adaptación más conocida es el efecto Warburg, donde los tumores aumentan su captación y utilización de glucosa . La glutamina es una de las sustancias conocidas que se utiliza en el ciclo de Krebs inverso para producir acetil-CoA. [13] Este tipo de actividad mitocondrial podría proporcionar una nueva forma de identificar y atacar las células que causan cáncer. [14]

Uso microbiano del ciclo de Krebs inverso.

Se ha demostrado que Thiomicrospira denitrificans, Candidatus Arcobacter y Chlorobaculum tepidum utilizan el ciclo rTCA para convertir el CO 2 en compuestos de carbono. La capacidad de estas bacterias, entre otras, para utilizar el ciclo rTCA, respalda la idea de que se derivan de una proteobacteria ancestral y que otros organismos que utilizan este ciclo son mucho más abundantes de lo que se creía anteriormente. [15]

Ver también

Referencias

  1. ^ ab Evans MC, Buchanan BB, Arnon DI (abril de 1966). "Un nuevo ciclo de reducción de carbono dependiente de ferredoxina en una bacteria fotosintética". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 55 (4): 928–934. Código bibliográfico : 1966PNAS...55..928E. doi : 10.1073/pnas.55.4.928 . PMC  224252 . PMID  5219700.
  2. ^ Buchanan BB, Arnon DI (1990). "Un ciclo KREBS inverso en la fotosíntesis: por fin consenso". Investigación sobre la fotosíntesis . 24 : 47–53. doi :10.1007/BF00032643. PMID  11540925. S2CID  2753977.
  3. ^ Bar-Even A, Noor E, Milo R (marzo de 2012). "Un estudio de las vías de fijación de carbono a través de una lente cuantitativa". Revista de Botánica Experimental . 63 (6): 2325–2342. doi : 10.1093/jxb/err417 . PMID  22200662.
  4. ^ Bar-Even A, Noor E, Milo R (marzo de 2012). "Un estudio de las vías de fijación de carbono a través de una lente cuantitativa". Revista de Botánica Experimental . 63 (6): 2325–2342. doi : 10.1093/jxb/err417 . PMID  22200662.
  5. ^ Zhang XV, Martin ST (diciembre de 2006). "Conducir partes del ciclo de Krebs en sentido inverso a través de la fotoquímica mineral". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 128 (50): 16032–16033. doi :10.1021/ja066103k. PMID  17165745.
  6. ^ Muchowska KB, Varma SJ, Chevallot-Beroux E, Lethuillier-Karl L, Li G, Moran J (noviembre de 2017). "Los metales promueven secuencias del ciclo de Krebs inverso". Ecología y evolución de la naturaleza . 1 (11): 1716-1721. doi :10.1038/s41559-017-0311-7. PMC 5659384 . PMID  28970480. 
  7. ^ Ross DS (febrero de 2007). "La viabilidad de un ciclo reductor no enzimático del ácido cítrico: cinética y termoquímica". Orígenes de la vida y evolución de la biosfera . 37 (1): 61–65. Código Bib : 2007OLEB...37...61R. doi :10.1007/s11084-006-9017-6. PMID  17136437. S2CID  2208326.
  8. ^ Muchowska, Kamila B.; Varma, Sreejith J.; Moran, Joseph (1 de mayo de 2019). "Síntesis y degradación de precursores metabólicos universales promovida por el hierro". Naturaleza . 569 (7754): 104-107. Código Bib :2019Natur.569..104M. doi :10.1038/s41586-019-1151-1. ISSN  1476-4687. PMC 6517266 . PMID  31043728. 
  9. ^ Harrison SA, Palmeira RN, Halpern A, Lane N (noviembre de 2022). "Una base biofísica para el surgimiento del código genético en las protocélulas". Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergética . 1863 (8): 148597. doi : 10.1016/j.bbabio.2022.148597 . PMID  35868450.
  10. ^ Muchowska KB, Varma SJ, Moran J (agosto de 2020). "Reacciones metabólicas no enzimáticas y orígenes de la vida" (PDF) . Reseñas químicas . 120 (15): 7708–7744. doi :10.1021/acs.chemrev.0c00191. PMID  32687326. S2CID  220671580.
  11. ^ Akbari A, Palsson BO (mayo de 2023). "Homeostasis metabólica y crecimiento en células abióticas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 120 (19): e2300687120. Código Bib : 2023PNAS..12000687A. doi :10.1073/pnas.2300687120. PMC 10175716 . PMID  37126695. 
  12. ^ Ju, Yun; Zhang, Hong; Jiang, Yanxiao; Wang, Wenxin; Kan, Guangfeng; Yu, Kai; Wang, Xiaofei; Liu, Jilin; Jiang, Jie (7 de septiembre de 2023). "Las microgotas acuosas promueven la formación de enlaces C-C y secuencias en el ciclo inverso del ácido tricarboxílico". Ecología y evolución de la naturaleza : 1–11. doi :10.1038/s41559-023-02193-8. ISSN  2397-334X. PMID  37679455. S2CID  261609019.
  13. ^ Filipp FV, Scott DA, Ronai ZA, Osterman AL, Smith JW (mayo de 2012). "El flujo del ciclo inverso del TCA a través de las isocitrato deshidrogenasas 1 y 2 es necesario para la lipogénesis en células de melanoma hipóxico". Investigación de células pigmentarias y melanoma . 25 (3): 375–383. doi :10.1111/j.1755-148X.2012.00989.x. PMC 3329592 . PMID  22360810. 
  14. ^ Wise DR, Ward PS, Shay JE, Cross JR, Gruber JJ, Sachdeva UM, et al. (Diciembre de 2011). "La hipoxia promueve la carboxilación dependiente de isocitrato deshidrogenasa de α-cetoglutarato a citrato para favorecer el crecimiento y la viabilidad celular". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (49): 19611–19616. Código Bib : 2011PNAS..10819611W. doi : 10.1073/pnas.1117773108 . PMC 3241793 . PMID  22106302. 
  15. ^ Hügler M, Wirsen CO, Fuchs G, Taylor CD, Sievert SM (mayo de 2005). "Evidencia de fijación autótrofa de CO2 a través del ciclo reductor del ácido tricarboxílico por miembros de la subdivisión épsilon de proteobacterias". Revista de Bacteriología . 187 (9): 3020–3027. doi :10.1128/JB.187.9.3020-3027.2005. PMC 1082812 . PMID  15838028.