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Código mitocondrial de pterobranchia

El código mitocondrial de pterobranchia (tabla de traducción 24 ) es un código genético utilizado por el genoma mitocondrial de Rhabdopleura compacta ( Pterobranchia ). Los Pterobranchia son uno de los dos grupos de los Hemichordata que, junto con los Echinodermata y Chordata, forman los tres linajes principales de deuteróstomos . AUA se traduce como isoleucina en Rhabdopleura como lo hace en Echinodermata y Enteropneusta , mientras que AUA codifica metionina en Chordata. La asignación de AGG a lisina no se encuentra en ninguna otra parte de las mitocondrias deuterostomadas, pero sí en algunos taxones de Arthropoda . [1] Este código comparte con muchos otros códigos mitocondriales la reasignación de UGA STOP a triptófano , y AGG y AGA a un aminoácido distinto de arginina . Los codones de iniciación en Rhabdopleura compacta son ATG y GTG. [1]

El código 24 es muy similar al código mitocondrial 33 de los pterobranquios. [2]

El código

   AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M---------------M---------------M---------------M------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
 Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
 Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Bases: adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T) o uracilo (U).

Aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina (Gln , Q), Glicina (Gly, G), Histidina (His, H), Isoleucina (Ile, I), Leucina (Leu, L), Lisina (Lys, K), Metionina (Met, M), Fenilalanina (Phe, F), prolina (Pro, P), serina (Ser, S), treonina (Thr, T), triptófano (Trp, W), tirosina (Tyr, Y), valina (Val, V)

Diferencias con el código estándar.

Ver también

Referencias

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público . [3]

  1. ^ ab Perseke, Marleen; Hetmank, Jörg; Bernt, Matías; Stadler, Peter F; Schlegel, Martín; Bernhard, Detlef (20 de mayo de 2011). "El enigmático genoma mitocondrial de Rhabdopleura compacta (Pterobranchia) revela información sobre la selección de un sistema de ARNt eficiente y respalda la monofilia de Ambulacraria". Biología Evolutiva del BMC . 11 (1): 134. doi : 10.1186/1471-2148-11-134 . ISSN  1471-2148. PMC  3121625 . PMID  21599892.
  2. ^ Li, Yuanning; Kocot, Kevin M.; Tasia, Michael G.; Cañón, Johanna T.; Bernt, Matías; Halanych, Kenneth M. (1 de enero de 2019). "La mitogenómica revela un nuevo código genético en hemichordata". Biología y evolución del genoma . 11 (1): 29–40. doi : 10.1093/gbe/evy254. PMC 6319601 . PMID  30476024. 
  3. ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "Los códigos genéticos". Navegador de taxonomía . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . Consultado el 28 de junio de 2014 .