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Mesa

Tabla de subunidades conservadas del complejo citocromo oxidasa c





Tabla de composición de subunidades del complejo III

El complejo bc1, o complejo III, contiene 11 subunidades: 3 subunidades respiratorias (citocromo b, citocromo c1 y Rieske/UQCRFS1), 2 proteínas centrales (UQCRC1/QCR1 y UQCRC2/QCR2) y 6 proteínas de bajo peso molecular (UQCRH/QCR6, UQCRB/QCR7, UQCRQ/QCR8, UQCR10/QCR9, UQCR11/QCR10 y un producto de escisión de Rieske/UQCRFS1. [5] [6]








|- | 1 || SdhA || SDHA_HUMAN || Subunidad de flavoproteína de la succinato deshidrogenasa [ubiquinona], mitocondrial ||PF00890, PF02910 |-

| 2 || SdhB || SDHB_HUMAN || Subunidad de hierro-azufre de la succinato deshidrogenasa [ubiquinona], mitocondrial ||PF13085, PF13183 |-


| 3 || SdhC || C560_HUMAN || Subunidad del citocromo b560 de la succinato deshidrogenasa, mitocondrial ||PF01127 |-


| 4 || SdhD || DHSD_HUMAN || Succinato deshidrogenasa [ubiquinona] citocromo b subunidad pequeña, mitocondrial ||PF05328 |-

|}


Tabla de subunidades ribosómicas pequeñas de E. coli

a  : Nombre alternativo Proteína ribosomal 30S S22: aunque esta proteína se asocia con la subunidad 30S del ribosoma, no se considera una proteína ribosomal auténtica . No es esencial para el crecimiento bacteriano. [7]

Tabla de subunidades pequeñas de los ribosomas humanos

Ensamblaje del ribosoma en eucariotas

Los ribosomas, que sintetizan el proteoma de las células, son ribonucleoproteínas complejas que, en los eucariotas , contienen 79-80 proteínas y cuatro ARN ribosómicos (ARNr). Las chaperonas generales o especializadas solubilizan las proteínas ribosómicas y facilitan su importación al núcleo . El ensamblaje del ribosoma eucariota parece estar impulsado por las proteínas ribosómicas in vivo cuando el ensamblaje también es ayudado por chaperonas. La mayoría de las proteínas ribosómicas se ensamblan con el ARNr de manera cotranscripcional, asociándose de manera más estable a medida que avanza el ensamblaje, y los sitios activos de ambas subunidades se construyen en último lugar. [8]

Experimentos recientes de proteómica de novo , en los que los autores caracterizaron intermediarios de ensamblaje de ribosomas in vivo y factores de ensamblaje asociados a partir de células de Escherichia coli de tipo salvaje utilizando un enfoque general de espectrometría de masas cuantitativa (qMS), han confirmado la presencia de todos los componentes de subunidades grandes y pequeñas conocidos y han identificado un total de 21 factores de ensamblaje de ribosomas conocidos y potencialmente nuevos que se co-localizan con varias partículas ribosómicas. [9]

Se cree que los ribosomas bacterianos y eucariotas, que comparten un núcleo conservado evolutivamente, evolucionaron a partir de un ancestro común mediante la adición de proteínas y ARN que otorgan diferentes funcionalidades a los ribosomas de diferentes dominios de la vida. [10] El término "el núcleo" se refiere a la parte estructuralmente conservada de los ribosomas 70S (de T. thermophilus y Escherichia coli) y los ribosomas 80S (de S. cerevisiae), deducidos mediante un procedimiento estándar de alineación estructural. [11]

Tabla de componentes de la subunidad grande del gen 60S humano

Infoboxes perdidos por ComplexI

Gestión de referencias

Tabla de subunidades conservadas de ComplexI[12][13]

Páginas en construcción

  1. ^ Szklarczyk R, Wanschers BF, Cuypers TD, Esseling JJ, Riemersma M, van den Brand MA; et al. (2012). "La predicción iterativa de la ortología descubre nuevas proteínas mitocondriales e identifica a C12orf62 como el ortólogo humano de COX14, una proteína involucrada en el ensamblaje de la citocromo c oxidasa". Genome Biol . 13 (2): R12. doi :10.1186/gb-2012-13-2-r12. PMC  3334569. PMID  22356826 . {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento CS1: formato PMC ( enlace ) Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace ) Mantenimiento CS1: DOI libre sin marcar ( enlace )
  2. ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I; et al. (2012). "MITRAC vincula la translocación de proteínas mitocondriales con el ensamblaje de la cadena respiratoria y la regulación de la traducción". Cell . 151 (7): 1528–41. doi :10.1016/j.cell.2012.11.053. PMID  23260140. {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  3. ^ Kozjak-Pavlovic V, Prell F, Thiede B, Götz M, Wosiek D, Ott C; et al. (2014). "C1orf163/RESA1 es una nueva proteína del espacio intermembrana mitocondrial conectada al ensamblaje de la cadena respiratoria". J Mol Biol . 426 (4): 908–20. doi :10.1016/j.jmb.2013.12.001. PMID  24333015. {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  4. ^ Gaisne M, Bonnefoy N (2006). "El gen COX18, implicado en la biogénesis mitocondrial, se conserva funcionalmente y se regula estrechamente en humanos y levaduras de fisión". FEMS Yeast Res . 6 (6): 869–82. doi :10.1111/j.1567-1364.2006.00083.x. PMID  16911509.
  5. ^ Zhang Z, Huang L, Shulmeister VM, Chi YI, Kim KK, Hung LW; et al. (1998). "Transferencia de electrones por movimiento de dominio en el citocromo bc1". Nature . 392 (6677): 677–84. doi :10.1038/33612. PMID  9565029. {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  6. ^ Hao GF, Wang F, Li H, Zhu XL, Yang WC, Huang LS; et al. (2012). "Descubrimiento computacional de inhibidores del sitio Q(o) picomolar del complejo citocromo bc1". J Am Chem Soc . 134 (27): 11168–76. doi :10.1021/ja3001908. PMID  22690928. {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  7. ^ Bubunenko M, Baker T, Court DL (2007). "Esencialidad de las proteínas antiterminación ribosómicas y de transcripción analizadas mediante reemplazo sistemático de genes en Escherichia coli". J Bacteriol . 189 (7): 2844–53. doi :10.1128/JB.01713-06. PMC 1855809 . PMID  17277072. {{cite journal}}: Mantenimiento CS1: formato PMC ( enlace ) Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  8. ^ Ban N, Beckmann R, Cate JH, Dinman JD, Dragon F, Ellis SR; et al. (2014). "Un nuevo sistema para nombrar proteínas ribosomales". Curr Opin Struct Biol . 24 : 165–9. doi :10.1016/j.sbi.2014.01.002. PMID  24524803. {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  9. ^ Chen SS, Williamson JR (2013). "Caracterización del paisaje de la biogénesis de ribosomas en E. coli mediante espectrometría de masas cuantitativa". J Mol Biol . 425 (4): 767–79. doi :10.1016/j.jmb.2012.11.040. PMC 3568210 . PMID  23228329. {{cite journal}}: Mantenimiento de CS1: formato PMC ( enlace )
  10. ^ Melnikov S, Ben-Shem A, Garreau de Loubresse N, Jenner L, Yusupova G, Yusupov M (2012). "Un núcleo, dos capas: ribosomas bacterianos y eucariotas". Nat Struct Mol Biol . 19 (6): 560–7. doi :10.1038/nsmb.2313. PMID  22664983.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  11. ^ Ben-Shem A, Garreau de Loubresse N, Melnikov S, Jenner L, Yusupova G, Yusupov M (2011). "La estructura del ribosoma eucariota con una resolución de 3,0 Å". Science . 334 (6062): 1524–9. doi :10.1126/science.1212642. PMID  22096102.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  12. ^ Cardol P (2011). "NADH mitocondrial: ubiquinona oxidorreductasa (complejo I) en eucariotas: una composición de subunidades altamente conservada resaltada mediante la minería de datos de proteínas". Biochim Biophys Acta . 1807 (11): 1390–7. doi :10.1016/j.bbabio.2011.06.015. PMID  21749854.
  13. ^ Vogel RO, Dieteren CE, van den Heuvel LP, Willems PH, Smeitink JA, Koopman WJ; et al. (2007). "La identificación de intermediarios del ensamblaje del complejo mitocondrial I mediante el rastreo de NDUFS3 marcado demuestra el punto de entrada de las subunidades mitocondriales". J Biol Chem . 282 (10): 7582–90. doi :10.1074/jbc.M609410200. PMID  17209039. {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace ) Mantenimiento CS1: DOI libre sin marcar ( enlace )
  14. ^ Ogilvie I, Kennaway NG, Shoubridge EA (2005). "Una chaperona molecular para el ensamblaje del complejo mitocondrial I está mutada en una encefalopatía progresiva". J Clin Invest . 115 (10): 2784–92. doi :10.1172/JCI26020. PMC 1236688 . PMID  16200211. {{cite journal}}: Mantenimiento CS1: formato PMC ( enlace ) Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  15. ^ Dunning CJ, McKenzie M, Sugiana C, Lazarou M, Silke J, Connelly A; et al. (2007). "El CIA30 humano está involucrado en el ensamblaje temprano del complejo mitocondrial I y las mutaciones en su gen causan enfermedades". EMBO J . 26 (13): 3227–37. doi :10.1038/sj.emboj.7601748. PMC 1914096 . PMID  17557076.  {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )CS1 maint: PMC format (link) CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  16. ^ Saada A, Vogel RO, Hoefs SJ, van den Brand MA, Wessels HJ, Willems PH; et al. (2009). "Las mutaciones en NDUFAF3 (C3ORF60), que codifica una proteína de ensamblaje del complejo I que interactúa con NDUFAF4 (C6ORF66), causan enfermedad mitocondrial neonatal fatal". Am J Hum Genet . 84 (6): 718–27. doi :10.1016/j.ajhg.2009.04.020. PMC 2694978 . PMID  19463981.  {{cite journal}}: Uso explícito de et al. en: |author=( ayuda )CS1 maint: PMC format (link) CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  17. ^ Brown NR, Noble (1995). "La estructura cristalina de la ciclina A". Estructura . 3 (11): 1235–47. PMID  8591034. {{cite journal}}: Se ignoró el texto "10.1016/S0969-2126(01)00259-3" ( ayuda ) ; Se ignoró el texto "ME, Endicott JA, et al. " ( ayuda )