La clasificación de las proteínas virales como proteínas tempranas o tardías depende de su relación con la replicación del genoma . Si bien muchos virus (como el VIH ) [1] se describen como que expresan proteínas tempranas y tardías , esta definición de estos términos se reserva comúnmente para los virus de ADN de clase I. (El VIH tiene dos etapas de expresión de proteínas , pero estas no son el resultado de dos etapas de transcripción que rodean la replicación, sino de la producción de la proteína Rev , que es necesaria para la exportación de las transcripciones del segundo conjunto de proteínas transcritas desde el núcleo celular ).
Las proteínas tempranas son aquellas que se producen después de la entrada a la célula huésped pero antes de la replicación . [1] La expresión de genes tempranos , que comúnmente codifican proteínas no estructurales, inicia la replicación del genoma y la expresión de genes tardíos.
En algunos virus más simples, este patrón de expresión está claramente definido, mientras que en aquellos con genomas más complejos, como los herpesvirus , estos períodos de expresión se superponen.
Un ejemplo de expresión génica temprana es la expresión del antígeno T pequeño, mediano y grande codificado por el poliomavirus . El antígeno T medio no es necesario para la replicación y actúa para mejorar la transcripción uniéndose a las proteínas del huésped que interactúan con el promotor tardío. Por otro lado, el antígeno T grande es necesario y actúa para iniciar la replicación directamente. Se une al origen viral de replicación y recluta a la ADN polimerasa y a la proteína de unión al ADN s/s de modo que una vez que su concentración es lo suficientemente grande, bloquea la transcripción de los genes tempranos e inicia la replicación del genoma. También actúa para provocar la entrada de la célula huésped en la fase S.
El bacteriófago T4 es un virus que infecta a la bacteria E. coli . Los genes del bacteriófago T4 se clasifican convencionalmente como genes de función temprana o genes de función tardía según el período de tiempo en el que se expresan sus productos proteicos durante el curso de la infección por bacteriófagos. En general, las proteínas tempranas producidas por los genes de función temprana actúan catalíticamente para promover la replicación y reparación del ADN específico del genoma del bacteriófago , así como para facilitar la modificación del grupo de nucleótidos del huésped para acomodar estas funciones. [2] Los genes de función tardía codifican proteínas tardías que están involucradas en la morfogénesis del virión del bacteriófago, particularmente proteínas no enzimáticas que comprenden los componentes estructurales del propio virus, pero también algunas proteínas catalíticas que facilitan este proceso de ensamblaje morfogenético. [2]