[1] Tras finalizar sus estudios secundarios en la Escuela Secundaria Habibia, ingresó a la Universidad de Al-Azhar en El Cairo, Egipto, en donde estudió ley islámica y jurisprudencia, y sacó títulos de posgrado, graduándose con honores.También hacía numerosos llamados a estudiantes e intelectuales de que no se influenciaran por las actividades comunistas del país, las cuales estaban siendo patrocinadas por los estados vecinos que conformaban la Unión Soviética, durante el período de la Guerra Fría.Dentro de la resistencia muyahidín, Mojaddedi mantuvo una postura muy moderada, manteniendo respeto hacia los valores internacionales, motivo por el que pudo realizar diálogos junto con otros líderes mundiales, con el objetivo de obtener apoyo hacia la causa afgana.Esta elección evidencia el altísimo apoyo y respeto que sentían los muyahidínes hacia Mojaddedi.A pesar de que los sectores muyahidínes más extremistas se opusieron ante la postura de Mojaddedi, este envió tropas a Arabia Saudita para resguardar los lugares sagrados del islam durante la guerra del Golfo.[1][2] Tras la gravísima inestabilidad causada por la guerra, los muyahidínes comienzan a tener un expansivo avance hacia el control de toda Afganistán, el cual iba adoptando una postura cada vez más extremista y fundamentalista islámica, que posteriormente daría paso al surgimiento del movimiento talibán.Mojaddedi regresó a Kabul mediante una comitiva desde Peshawar, y asumió la presidencia del recién creado Estado Islámico de Afganistán.Durante sus discursos, Mojaddedi afirmaba que la lucha por el poder era totalmente injustificable, y condenó la muerte innecesaria de civiles afganos.
