Las pinzas moleculares y los clips moleculares son moléculas anfitrionas con cavidades abiertas capaces de unir moléculas huésped. [3] La cavidad abierta de las pinzas moleculares puede unir huéspedes usando enlaces no covalentes , que incluyen enlaces de hidrógeno , coordinación de metales, fuerzas hidrofóbicas , fuerzas de van der Waals , interacciones π–π y/o efectos electrostáticos. Estos complejos son un subconjunto de receptores moleculares macrocíclicos y su estructura es que los dos "brazos" que unen la molécula huésped entre ellos solo están conectados en un extremo, lo que conduce a una cierta flexibilidad de estas moléculas receptoras (modelo de ajuste inducido).
Historia
El término "pinzas moleculares" fue utilizado por primera vez por Whitlock. [4] La clase de huéspedes fue desarrollada y popularizada por Zimmerman a mediados de los años 1980 y principios de los años 1990 [5] [6] [7] y más tarde por Klärner. [8]
Stoermer y sus colaboradores describieron hendiduras capaces de capturar moléculas de ciclohexano o cloroformo. Curiosamente, las interacciones pi desempeñaron un papel clave en la captura de huéspedes, así como en la tasa de formación de hendiduras. [10]
Las pinzas moleculares sustituidas con fosfato solubles en agua hechas de sustituyentes fenilo y norbornenilo alternados se unen a cadenas laterales alifáticas cargadas positivamente de aminoácidos básicos, como lisina y arginina (Figura 3). [11] [12] Compuestos similares llamados "clips moleculares", cuyas paredes laterales son planas en lugar de convexas, prefieren encerrar anillos de piridinio planos (por ejemplo, el anillo de nicotinamida de NAD(P)+) entre sus paredes laterales planas de naftaleno (Figura 4). [13] Estos modos de unión mutuamente excluyentes hacen que estos compuestos sean herramientas valiosas para investigar interacciones biológicas críticas de cadenas laterales de aminoácidos básicos en péptidos y proteínas, así como de NAD(P) + y cofactores similares. Por ejemplo, ambos tipos de compuestos inhiben las reacciones de oxidación del etanol por la alcohol deshidrogenasa o de la glucosa-6-fosfato por la glucosa-6-fosfato deshidrogenasa , [14] respectivamente.
Las pinzas moleculares, pero no los clips, inhiben eficazmente la formación de oligómeros tóxicos y agregados por proteínas amiloidogénicas asociadas con diferentes enfermedades. Los ejemplos incluyen las proteínas involucradas en la enfermedad de Alzheimer : proteína β amiloide (Aβ) y tau; [15] [16] [17] α-sinucleína, que se cree que causa la enfermedad de Parkinson y otras sinucleinopatías [18] [19] [20] [21] y está involucrada en la lesión de la médula espinal ; [22] huntingtina mutante, que causa la enfermedad de Huntington; [23] polipéptido amiloide de los islotes (amilina), que mata las células β pancreáticas en la diabetes tipo 2 ; [24] transtiretina (TTR), que causa polineuropatía amiloide familiar, miocardiopatía amiloide familiar y amiloidosis sistémica senil; [25] mutantes propensos a la agregación de la proteína supresora de tumores p53 ; [26] y proteínas del semen cuya agregación mejora la infección por VIH . [27] Es importante destacar que se ha descubierto que las pinzas moleculares son efectivas y seguras no solo en el tubo de ensayo sino también en modelos animales de diferentes enfermedades, [28] [29] lo que sugiere que se pueden desarrollar como medicamentos contra enfermedades causadas por agregación anormal de proteínas, todas las cuales actualmente no tienen cura. También se demostró que destruyen las membranas de virus envueltos, como el VIH, el herpes y la hepatitis C, [27] lo que las convierte en buenas candidatas para el desarrollo de microbicidas.
Los ejemplos anteriores muestran la reactividad y especificidad potenciales de estas moléculas. La cavidad de unión entre los brazos laterales de la pinza puede evolucionar para unirse a un huésped apropiado con alta especificidad, dependiendo de la configuración de la pinza. Eso hace que esta clase general de macromoléculas sean receptores moleculares verdaderamente sintéticos con aplicaciones importantes para la biología y la medicina. [30] [31] [32]
^ ab A. Petitjean; RG Khoury; N. Kyritsakas; JM Lehn (2004). "Dispositivos dinámicos. Cambio de forma y unión del sustrato en pinzas moleculares nanomecánicas controladas por iones". J. Am. Chem. Soc. 126 (21): 6637–6647. doi :10.1021/ja031915r. PMID 15161291.
^ ab A. Sygula; FR Fronczek; R. Sygula; PW Rabideau; MM Olmstead (2007). "Un anzuelo de hidrocarburos de doble cóncavo". J. Am. Chem. Soc. 129 (13): 3842–3843. doi :10.1021/ja070616p. PMID 17348661. S2CID 25154754.
^ Hardouin-Lerouge, M.; Hudhomme, P.; Salle, M. (2011). "Pinzas y clips moleculares que albergan huéspedes neutrales" (PDF) . Chemical Society Reviews . 40 (1): 30–43. doi :10.1039/B915145C. PMID 21038068.
^ Chen C.-W.; Whitlock HW "Pinzas moleculares: un modelo simple de intercalación bifuncional", J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 4921
^ Zimmerman, SC; VanZyl, CM "Pinzas moleculares rígidas: síntesis, caracterización y química de formación de complejos de una diacridina", J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 7894.
^ Zimmerman, SC; Wu, W. "Una pinza molecular rígida con un sitio activo de ácido carboxílico: receptor excepcionalmente eficiente para adenina en un solvente orgánico", J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8054.
^ Zimmerman, SC "Pinzas moleculares rígidas como anfitriones para la formación de complejos de huéspedes neutrales", Top. Curr. Chem. 1993, 165, 71.
^ F.-G. Klärner y B. Kahlert (2003). "Pinzas y clips moleculares como receptores sintéticos. Reconocimiento molecular y dinámica en complejos receptor-sustrato". Acc. Chem. Res. 36 (12): 919–932. doi :10.1021/ar0200448. PMID 14674783. S2CID 29313731.
^ X. Huang; N. Fujioka; G. Pescitelli; F. Koehn; RT Williamson; K. Nakanishi; N. Berova (2002). "Asignaciones configuracionales absolutas de aminas secundarias por huésped de porfirina de zinc dimérica sensible a CD". J. Am. Chem. Soc. 124 (17): 10320–10335. doi :10.1021/ja020520p. PMID 12197735. S2CID 33852448.
^ Stoermer, Martin J.; Wickramasinghe, Wasantha A.; Byriel, Karl A.; Hockless, David CR; Skelton, Brian W.; Sobolev, Alexandre N.; White, Allan H.; Mak, Jeffrey YW; Fairlie, David P. (8 de diciembre de 2017). "Los efectos estereoelectrónicos en la separación de dienófilos influyen en la síntesis de hendiduras moleculares de Diels-Alder" (PDF) . Revista Europea de Química Orgánica . 2017 (45): 6793–6796. doi : 10.1002/ejoc.201701319 . ISSN 1099-0690.
^ M Fokkens, T Schrader y FG Klärner. Una pinza molecular para la lisina y la arginina. J. Am. Chem. Soc. 2005; 127: 14415–14421.
^ P. Talbiersky; F. Bastkowski; F.-G. Klärner; T. Schrader (2008). "Molecular Clip and Tweezer Introducen New Mechanisms of Enzyme Inhibition" (Pinza y clip moleculares introducen nuevos mecanismos de inhibición enzimática). J. Am. Chem. Soc. 130 (30): 9824–9828. doi :10.1021/ja801441j. PMID 18605724.
^ J. Polkowska; F. Bastkowski; T. Schrader; F.-G. Klärner; J. Zienau; F. Koziol; C. Ochsenfeld (2009). "Un estudio experimental y teórico combinado del modo de unión dependiente del pH de NAD+ mediante clips moleculares solubles en agua". J. Phys. Org. Chem . 22 (30): 779–790. doi :10.1002/poc.1519.
^ M. Kirsch; P. Talbiersky; J. Polkowska; F. Bastkowski; T. Schaller; H. de Groot; F.-G. Klärner; T. Schrader (2009). "Un mecanismo de inhibición eficiente de G6PD mediante un clip molecular". Angew. Chem. Int. Ed. 48 (16): 2886–2890. doi :10.1002/anie.200806175. PMID 19283805.
^ S Sinha, DHJ Lopes, Z Du, ES Pang, A Shanmugam, A Lomakin, P Talbiersky, A Tennstaedt, K McDaniel, R Bakshi, PY Kuo, M Ehrmann, GB Benedek, JA Loo, FG Klärner, T Schrader, C Wang y G Bitan. Las pinzas moleculares específicas de lisina son inhibidores de amplio espectro de la agregación y la toxicidad de las proteínas amiloides. J. Am. Chem. Soc. 2011; 133(42): 16958–16969.
^ S Sinha, Z Du, P Maiti, FG Klärner, T Schrader, C Wang y G Bitan. Comparación de tres inhibidores del ensamblaje de amiloide: el azúcar escilo-inositol, el polifenol galato de epigalocatequina y el Molecular Tweezer CLR01. ACS Chem. Neurosci. 2012; 3(6): 451–458.
^ X Zheng, DY Liu, FG Klärner, T Schrader, G Bitan y MT Bowers. Ensamblaje de la proteína β amiloide: el efecto de Molecular Tweezer CLR01 y CLR03. J. Phys. Chem. B, 2015; 119: 4831–4841.
^ S Prabhudesai*, S Sinha*, A Attar, A Kotagiri, AG Fitzmaurice, R Lakshmanan, MI Ivanova, JA Loo, FG Klärner, T Schrader, M Stahl, G Bitan# y JM Bronstein#. Un nuevo inhibidor de la neurotoxicidad de la α-sinucleína en forma de "pinza molecular" in vitro e in vivo. Neurotherapeutics. 2012; 9(2): 464–476.
^ S Acharya, BM Safaie, P Wongkongkathep, MI Ivanova, A Attar, FG Klärner, T Schrader, JA Loo, G Bitan y LJ Lapidus. Base molecular para prevenir la agregación de α-sinucleína mediante una pinza molecular. J. Biol. Chem. 2014; 289(15): 10727–10737.
^ A Lulla, L Barnhill, G Bitan, MI Ivanova, B Nguyen, K O'Donnell, MC Stahl, C Yamashiro, FG Klärner, T Schrader, A Sagasti y JM Bronstein, Environ. Health Perspect. 2016; 124: 1766–1775. Archivado el 5 de julio de 2017 en Wayback Machine.
^ Richter, Franziska; Subramaniam, Sudhakar R.; Magen, Iddo; Lee, Patrick; Hayes, Jane; Attar, Aida; Zhu, Chunni; Franich, Nicholas R.; Bove, Nicholas (5 de junio de 2017). "Una pinza molecular mejora los déficits motores en ratones que sobreexpresan α-sinucleína". Neurotherapeutics . 14 (4): 1107–1119. doi :10.1007/s13311-017-0544-9. ISSN 1933-7213. PMC 5722755 . PMID 28585223.
^ SM Fogerson, AJ van Brummen, DJ Busch, SR Allen, R Roychaudhuri, S Banks, FG Klärner, T Schrader, G Bitan y JR Morgan, La reducción de la acumulación de sinucleína mejora la supervivencia neuronal después de una lesión de la médula espinal, Exp. Neurol. 2016; 278: 105–115.
^ Vöpel, Tobías; Bravo-Rodríguez, Kenny; Mittal, Sumit; Vachharajani, Shivang; Gnutt, David; Sharma, Abhishek; Steinhof, Ana; Fatoba, Oluwaseun; Ellrichmann, Gisa (26 de abril de 2017). "Inhibición de la agregación del exón-1 de Huntingtina mediante la pinza molecular CLR01". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 139 (16): 5640–5643. doi : 10.1021/jacs.6b11039. ISSN 0002-7863. PMC 5506490 . PMID 28406616.
^ DHJ Lopes, A Attar, G Nair, EY Hayden, Z Du, K McDaniel, S Dutt, K Bravo-Rodriguez, S Mittal, FG Klärner, C Wang, E Sanchez-Garcia, T Schrader y G Bitan (2015) Las pinzas moleculares inhiben el ensamblaje y la toxicidad del polipéptido amiloide de los islotes mediante un nuevo mecanismo, ACS Chem. Biol. 2015; 10: 1555–1569.
^ N Ferreira, A Pereira-Henriques, A Attar, FG Klärner, T Schrader, G Bitan, L Gales, MJ Saraiva y MR Almeida. Pinzas moleculares dirigidas a la amiloidosis por transtiretina. Neurotherapeutics. 2014; 11: 450–461.
^ G Herzog, MD Shmueli, L Levi, L Engel, E Gazit, FG Klärner, T Schrader, G Bitan y D Segal. La pinza molecular específica de Lys, CLR01, modula la agregación del dominio de unión al ADN del p53 mutante e inhibe su toxicidad, Biochemistry, 2015; 54: 3729–3738.
^ ab E Lump, LM Castellano, C Meier, J Seeliger, N Erwin, B Sperlich, CM Stürzel, S Usmani, RM Hammond, J von Einem, G Gerold, F Kreppel, K Bravo-Rodríguez, T Pietschmann, VM Holmes, D Palesch, O Zirafi, D Weissman, A Sowislok, B Wettig, C Heid, F Kirchhoff, T Weil, FG Klärner, T Schrader, G Bitan, E Sanchez-Garcia, R Winter, J Shorter y Jan Münch, A molecular la pinza antagoniza los amiloides seminales y la infección por VIH, eLife, 2015; 4:e05397.
^ A Attar, C Ripoli, E Riccardi, P Maiti, DD Li Puma, T Liu, J Hayes, MR Jones, K Lichti-Kaiser, F Yang, GD Gale, Ch Tseng, M Tan, CW Xie, JL Straudinger, FG Klärner, T Schrader, SA Frautschy, C Grassi y G Bitan. Protección de neuronas primarias y cerebro de ratón frente a la patología de Alzheimer mediante pinzas moleculares. Cerebro. 2012; 135(Pt 12): 3735–3748.
^ A Attar, W-TC Chan, FG Klärner, T Schrader y G Bitan. Seguridad y caracterización farmacológica de la pinza molecular CLR01: un inhibidor de amplio espectro de la toxicidad de las proteínas amiloides. BMC Pharm. Tox. 2014; 15(23): doi:10.1186/2050-6511-15-23.
^ FG Klärner y T Schrader. Interacciones aromáticas mediante pinzas y clips moleculares en sistemas químicos y biológicos. Acc. Chem. Res. 2013; 46: 967–978.
^ A Attar y G Bitan. Interrupción del autoensamblaje y toxicidad de oligómeros de proteínas amiloidogénicas mediante "pinzas moleculares": del tubo de ensayo a los modelos animales, Curr. Pharm. Des. 2014; 20: 2469–2483.
^ T Schrader, G Bitan y FG Klärner, Pinzas moleculares para lisina y arginina: potentes inhibidores de la agregación proteica patológica, Chem. Commun. 2016: 52: 11318–11334.