Partitiviridae es una familia de virus de ARN bicatenario . [2] Las plantas , los hongos y los protozoos sirven como huéspedes naturales. Se ha sugerido que también pueden infectar a las bacterias . [3] El nombre proviene del latín partitius, que significa dividido, y se refiere al genoma segmentado de los partitivirus. Hay cinco géneros y 60 especies en la familia, 15 de las cuales no están asignadas a un género. [4] [5]
Estructura
Penicillium stoloniferum virus F (PsV-F), gammapartititvirus y dímero CP de PsV-F
Los virus de la familia Partitiviridae no tienen envoltura, tienen geometrías icosaédricas y simetría T=1. [6] El diámetro de los partitivirus es de alrededor de 25 a 43 nm. [4]
Genoma
Genoma del virus Atkinsonella Hypoxylon (AhV) del género Betapartitivirus
Los partitivirus tienen genomas de ARN bicatenario divididos en dos segmentos genómicos, y puede haber segmentos subgenómicos adicionales. Los dos segmentos del genoma están empaquetados en partículas virales separadas. Codifican dos proteínas separadas. El primer segmento codifica la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), y el segundo segmento codifica la proteína de la cubierta . Los segmentos tienen una longitud de alrededor de 1,4 a 3,0 kbp, mientras que la longitud total del genoma es de alrededor de 3,0 a 4,8 kbp. [4] [6]
Ciclo vital
La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra mediante la penetración en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de replicación del virus ARN bicatenario. La transcripción del virus ARN bicatenario es el método de transcripción. El virus sale de la célula huésped mediante el movimiento de célula a célula. Los hongos y las plantas sirven como huésped natural. [4] [6] Los cryspovirus infectan protozoos apicomplejos del género Cryptosporidium , [7] mientras que los virus de los otros géneros infectan plantas y hongos. Se ha sugerido que también pueden infectar bacterias.
Filogenética
Basándose en el gen de la ARN polimerasa, este grupo se puede dividir en cuatro clados (I-IV). [8] Cuatro aislamientos de animales y protozoos forman un quinto clado. Los clados I-IV consisten en mezclas de secuencias similares a partitivirus de plantas y hongos. [ cita requerida ]
Taxonomía
Árbol filogenético de Partitiviridae
Hay cinco géneros reconocidos dentro de la familia Partitiviridae . Hay otras quince especies de la familia que no están asignadas a un género: [4] [5]
Alfapartitivirus
Virus críptico de la remolacha n.º 1
Virus críptico de la zanahoria
Partitivirus asociado a la mancha oxidada clorótica de la cereza
Virus críptico Chondrostereum purpureum 1
Virus del pardeamiento causado por Flammulina velutipes
^ Tang, J.; Pan, J.; Havens, WM; Ochoa, WF; Guu, TSY; Ghabrial, SA ; Nibert, ML; Tao, YJ; Baker, TS (2010). "Rastro de la estructura principal de la proteína de la cápside del Partitivirus a partir de la criomicroscopía electrónica y el modelado de homología". Biophysical Journal . 99 (2): 685–694. Bibcode :2010BpJ....99..685T. doi :10.1016/j.bpj.2010.04.058. PMC 2905076 . PMID 20643089.
^ Vainio, EJ; Chiba, S; Ghabrial, SA; Maiss, E; Roossinck, M; Sabanadzovic, S; Suzuki, N; Xie, J; Nibert, M; Informe Ictv, Consorcio (enero 2018). "Perfil de taxonomía de virus ICTV: Partitiviridae". La Revista de Virología General . 99 (1): 17-18. doi :10.1099/jgv.0.000985. PMC 5882087 . PMID 29214972.
^ Neri U, Wolf YI, Roux S, Camargo AP, Kazlauskas D, Min Chen I, Lee B, Ivanova N, Allen LZ, Paez-Espino D, Bryant DA, Bhaya D, Krupovic M, Dolja VV, Kyrpides NC, Koonin EV, Gophna U (17 de febrero de 2022). "Una expansión cinco veces mayor del viroma de ARN global revela múltiples clados nuevos de bacteriófagos de ARN". bioRxiv 10.1101/2022.02.15.480533 .
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^ ab "Taxonomía de virus: publicación de 2020". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021. Consultado el 20 de mayo de 2021 .
^ abc "Viral Zone". ExPASy . Consultado el 15 de junio de 2015 .
^ Nibert ML, Woods KM, Upton SJ, Ghabrial SA (2009) Cryspovirus: un nuevo género de virus protozoarios de la familia Partitiviridae. Arco Virol 154(12):1959–1965
^ Liu H, Fu Y, Xie J, Cheng J, Ghabrial SA, Li G, Yi X, Jiang D (2012) Descubrimiento de nuevas secuencias virales de dsRNA mediante clonación in silico e implicaciones para la diversidad viral, la gama de hospedadores y la evolución. PLoS One. 2012;7(7):e42147.
