La geografía física del País Vasco es muy diversa a pesar del pequeño tamaño de la región. El territorio alberga una mezcla de tonos verdes y marrones a amarillentos, presentando un terreno completamente montañoso. El País Vasco se extiende desde el agreste paisaje costero hasta el semidesierto de las Bardenas en la franja sureste de Navarra.
Los principales límites naturales del País Vasco son el Golfo de Vizcaya (sureste del Mar Cantábrico ) al norte y oeste, y al sur, el río Ebro . El punto más alto del País Vasco es el pico Hiru Erregeen Mahaia (2438 m de altura).
La costa del País Vasco tiene tres lados. La costa de Vizcaya es accidentada pero en general hay grandes playas. También hay al menos dos grandes rías, la de Ibaizabal (conocida también como Ría de Bilbao) y la de Urdaibai .
La costa de Gipuzkoa muestra un relieve más accidentado y en general las pendientes son más pronunciadas. Desde el límite de Bizkaia hasta Zumaia hay playas más pequeñas y más rocosas. Al este de Zumaia son de mayor tamaño y longitud. Cuando diferentes ríos se unen al mar, se pueden encontrar pequeños estuarios ( Oria ), y en los demás, brazos marítimos ( Urumea , Bidasoa ).
La costa de Lapurdi es más plana. Las playas son más largas y las pendientes más suaves. Los ríos Bidasoa y Adour desembocan en el océano en Lapurdi.
El País Vasco es montañoso. La mayoría de las montañas se encuentran a lo largo de un eje este-oeste, al oeste de los Pirineos .
La roca más importante allí es la piedra caliza , pero también hay montañas compuestas por otros materiales. Por ejemplo, Aiako Harria está compuesta de granito .
La montaña más alta es Hiru Errege Maila.
El sur de Álava y Navarra es el límite medio oriente de la Cordillera Cantábrica . Hay montes como Kodes y Toloño. Entre esas importantes montañas se encuentran Euskal mendiak: Urbasa , Andia , Aralar , Anboto , Ordunte o Aizkorri .
El Ebro es el río más grande que atraviesa el País Vasco. Tiene 910 km de longitud y discurre a lo largo del límite sur del País Vasco antes de desembocar en el mar Mediterráneo . En su recorrido hacia el este, el Ebro capta el agua de una serie de afluentes, como el Zadorra , Baias, Ega y Aragón . El recorrido de Aragón es el más largo, con 192 km. El río nace en Astún, situada en Aragón; desciende pasando el embalse de Esa, y atraviesa después el este de Navarra hasta desembocar en el río Ebro.
Aturri, que desemboca en el mar en la costa del País Vasco, es el río más caudaloso y de mayor caudal. Nace en Tourmalet y desemboca en el mar en Baiona, recorre 335 km de tierra, los últimos 30 km en el País Vasco. Tiene varios afluentes procedentes del Pirineo, entre ellos el Biduze, Errobi y Aran . Al igual que el Aturri, otros ríos vascos desembocan en el mar en el Golfo de Vizcaya, como el Nerbioi, el Bidasoa, el Oria, el Deba, el Urola y el Urumea. El Nerbioi es el río más largo del País Vasco, con una longitud de 75 km.
El bosque de Irati es el más extenso del País Vasco, y uno de los principales hayedos de Europa. Abarca partes de la Baja Navarra , Zuberoa y la Navarra española.
Por lo demás, desde Sakana hasta Aezkoa extendiéndose por todo el norte de Navarra, abundan los bosques caducifolios . Esta especie de árboles también se encuentran en el este de Álava, en la comarca denominada Mendialdea y Araialdea, y en Zuberoa y Baja Navarra. También existen en Gipuzkoa, en pleno Urola y en Aralar.
En Bizkaia existen bosques siempreverdes en el 66% de la provincia. Las principales excepciones de esto son algunos lugares de Enkarterri y en Durango ( Parque Natural de Urkiola ). En Gipuzkoa el 56% del arbolado que hay son coníferas, pero en Álava sólo representan el 28% del arbolado.
Actualmente, el 55% del País Vasco está cubierto de árboles, y en Navarra la cifra es del 45%.
El parque natural de Barde es el desierto más grande , y está situado en el sureste de Navarra. Tiene una superficie de 41.845 hectáreas. Tiene 45 km de norte a sur y 24 km de oeste a este.