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Michael Eisen

Michael Bruce Eisen (born April 13, 1967) is an American computational biologist and the former[2] editor-in-chief of the journal eLife.[3] He is a professor of genetics, genomics and development at University of California, Berkeley.[4][5][6][7][8] He is a leading advocate of open access scientific publishing and is co-founder of Public Library of Science (PLOS). In 2018, Eisen announced his candidacy U.S. Senate from California as an Independent, though he failed to qualify for the ballot.[9]

Early life and education

Born in Boston, Eisen and his brother Jonathan were raised in a family of scientists. Their grandfather was an x-ray crystallographer, their father, Howard Eisen a physician, and mother, Laura[10] a biochemist. They moved to Bethesda, Maryland when Eisen was four or five years old. The brothers spent summers in Long Island with their grandparents. Eisen states that he loved frogs and salamanders '"Even more than I have a frog fetish, I have a swamp fetish. I really like being in swamps."' He was also very interested in math and was captain of the high school math team. Eisen graduated from Walt Whitman High School in 1985. Intending to major in mathematics at Harvard University, he realized that there [he may encounter] other more brilliant math students, it was a Good Will Hunting moment and he decided that he did not want to major in mathematics, '"You don't want to be Salieri to Mozart."' During his years at Harvard, Eisen worked on "unlocking the three-dimensional structures of proteins." He was shown a DNA microarray which taught him a '"new way of doing biology"'.[11]

Eisen completó su doctorado en biofísica en la Universidad de Harvard y una licenciatura (también de Harvard) en matemáticas. [12] Estuvo bajo la supervisión de Don Craig Wiley [13] mientras estudiaba las proteínas del virus de la influenza A. [14]

Hay cosas que son realmente difíciles, ese es el tipo de problemas en los que uno quiere trabajar. No es tan fácil distinguir entre problemas imposibles y un problema realmente muy difícil. Pero aprender a hacerlo es de vital importancia. - Cosas que aprendí trabajando con Pat Brown ( Patrick O. Brown ) - 2015 [13]

Después de obtener su doctorado, Eisen fue becario postdoctoral en la Universidad de Stanford en el laboratorio de David Botstein , donde desarrolló en particular un método para interpretar datos de expresión genética a partir de microarrays. La publicación de investigación fundamental que escribió Eisen sobre este proyecto ha sido citada más de 16.000 veces. [15]

Béisbol y biología

Cuando Eisen vivía en Tennessee, trabajó como locutor jugada por jugada para un equipo de béisbol de ligas menores, [12] los Columbia Mules. Es un autoproclamado fanático de los Medias Rojas . [11] Él y el biólogo computacional James Fraser grabaron un video para iBiology sobre el papel que las estadísticas del béisbol influyeron en su investigación. Su argumento es que secuenciar el ADN es similar a anotar puntos en un partido de béisbol, y que muchos biólogos computacionales aprendieron a pensar en cálculos científicos a partir de un interés obsesivo por las estadísticas del béisbol. El ejercicio de comparar las estadísticas de un jugador específico con una base de datos de otros jugadores similares permite a un aficionado al béisbol predecir el rendimiento futuro. Este mismo sistema trabaja con proteínas y funciones de predicción. A medida que se desarrollen herramientas que desglosen y rastreen todas las estadísticas relativas a los jugadores de béisbol, la tecnología mejorará con la genética. Tanto con el béisbol como con la genética, se están desarrollando herramientas que refinan los modelos. [16] En una conferencia en 2015, Eisen declaró que recibió una computadora de su abuelo por su duodécimo cumpleaños y pasó los siguientes cinco años enseñándose a sí mismo a programar para poder realizar un seguimiento de las estadísticas de béisbol. [13]

Investigación

Su investigación académica se centra en la evolución de la regulación genética . [17] [18] [19] [20] A pesar de este enfoque, el trabajo de Eisen históricamente ha abarcado disciplinas muy diversas. Por ejemplo, sus cinco artículos más citados cubren una amplia gama de temas, incluidos métodos de agrupamiento jerárquico , [17] aplicaciones a cánceres de mama humanos (con David Botstein y Charles Perou), [6] y el descubrimiento de subtipos de tumores en células B grandes difusas. linfoma (con Ash Alizadeh y Louis Staudt ). [18] Su trabajo de investigación más reciente ha sido sobre las moscas de la fruta y Drosophila [21] y cómo "se desarrollan desde un pequeño huevo unicelular hasta un adulto maduro". Dice que contienen información sobre lo que va mal en las personas a medida que envejecen. " [12] Recibe financiación del Instituto Médico Howard Hughes para su investigación. [21]

Carrera por el Senado de EE. UU. 2018

Eisen anunció a través de Twitter el 25 de enero su intención de postularse para el Senado de los Estados Unidos desde California en 2018 para el puesto de la senadora demócrata Dianne Feinstein , registrando el identificador de Twitter SenatorPhD . [22] El lema de su campaña fue "Libertad, Igualdad, Realidad". Las razones de Eisen para postularse para el Congreso incluyeron su percepción de que la administración Trump no respondió al cambio climático y otras cuestiones relacionadas con la ciencia. Otra razón por la que Eisen decidió postularse fue su experiencia al ver a los miembros del gabinete entrevistados por el Senado sobre el cambio climático. Pensó: "Sería realmente bueno que los científicos hicieran las preguntas de los designados por el Gabinete, porque los senadores no parecen entender el tema y no están haciendo las preguntas correctas". [ 12] Él siente que si la ciencia Para estar a la vanguardia de la formulación de políticas, "los científicos deben postularse para cargos públicos". Consideró que las primarias en la jungla de California de 2018 le brindaron una mejor oportunidad de llegar a los dos últimos para las elecciones generales, pero no llegó a la final. dos (que fueron Dianne Feinstein y Kevin de León ). [12]

Durante mucho tiempo, los científicos han observado cómo se erosionan los procesos políticos y han visto a los políticos burlarse abiertamente de la ciencia, descartando el papel que desempeña en nuestra vida cotidiana. Los científicos han estado sentados aquí esperando que alguien venga y defienda esos principios. En mi opinión, la política debería funcionar de manera similar a la ciencia. Deberíamos tratar de descubrir qué está pasando en el mundo y luego debatir la mejor manera de hacerlo, de mejorar el mundo. Las mejores herramientas que tenemos para caracterizar la realidad son las herramientas de observación que la ciencia utiliza todo el tiempo. Gran parte de la política ha rechazado ese principio básico de que los científicos viven y respiran todo el tiempo. [12]

Eisen abandonó la carrera cuando no pudo calificar para las elecciones primarias de junio de 2018. [23]

Redacción y despido de eLife

En 2019, Eisen fue nombrado segundo editor en jefe de la revista científica de acceso abierto eLife . Bajo su liderazgo, la revista se alejó del modelo tradicional de " revisar y luego publicar ", requiriendo en cambio que los autores enviaran preimpresiones y luego publicando las reseñas de los editores de la revista junto con los manuscritos, lo que significa que la revista no aceptó ni rechazó los envíos. [24] Eisen dijo que la medida tenía como objetivo reducir la prominencia del editor y, en cambio, centrar la atención en los autores y su trabajo.

Eisen fue despedido de eLife el 23 de octubre de 2023 después de tuitear una historia de The Onion con el titular: "Los moribundos de Gaza son criticados por no utilizar las últimas palabras para condenar a Hamás". Eisen dijo: "The Onion habla con más coraje, perspicacia y claridad moral que los líderes de todas las instituciones académicas juntas. Ojalá hubiera una universidad @TheOnion". [25] Al menos cinco de los editores de eLife dimitieron y otros científicos dijeron que dejarían de participar en eventos de eLife en solidaridad con Eisen. Se organizó una carta de petición para protestar contra el despido de Eisen. La petición, que fue firmada por más de 2.000 científicos, académicos e investigadores, decía que la acción de eLife está teniendo un "efecto paralizador" sobre la libertad de expresión en el mundo académico. [26]

Defensa del acceso abierto

A lo largo de su carrera ha sido un defensor de la " ciencia abierta ", que es la libre difusión del producto material e intelectual de la investigación científica. Es un destacado defensor de las publicaciones científicas de acceso abierto [27] [28] [29] y es cofundador de la Biblioteca Pública de Ciencias (PLOS) y forma parte de la junta de PLOS, el Comité Académico de Dirección y Defensa de la Biblioteca Abierta de Humanidades. , [30] y es asesor de Science Commons .

En 2012, Eisen comenzó a protestar contra la Ley de Trabajos de Investigación como parte de su llamamiento para promover el acceso abierto a la información. [31]

Premios y honores

En 2002, Eisen recibió el premio inaugural Benjamin Franklin en bioinformática, por su trabajo en PLOS y la disponibilidad de acceso abierto de su software de análisis de conglomerados de microarrays. [32]

Referencias

  1. ^ Publicaciones de Michael Eisen indexadas por Google Scholar
  2. ^ Personal de Science News (24 de octubre de 2023). "Destacado editor de una revista despedido por respaldar un artículo satírico sobre el conflicto entre Israel y Hamas". Ciencia . Archivado desde el original el 24 de octubre de 2023 . Consultado el 24 de octubre de 2023 .
  3. ^ "eLife da la bienvenida a Michael Eisen como editor en jefe". eVida . 2019-03-05 . Consultado el 5 de marzo de 2019 .
  4. ^ "Michael B. Eisen, doctorado". Instituto Médico Howard Hughes . Consultado el 23 de septiembre de 2013 .
  5. ^ Publicaciones de Michael Eisen indexadas por la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
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  8. ^ Ross, DT; Scherf, U; Eisen, MB; Peroú, CM; Rees, C; Spellman, P; Iyer, V; Jeffrey, SS; Van De Rijn, M; Waltham, M; Pergamenschikov, A; Lee, JC; Lashkari, D; Shalón, D; Myers, TG; Weinstein, JN; Botstein, D; Marrón, PO (2000). "Variación sistemática en los patrones de expresión génica en líneas celulares de cáncer humano". Genética de la Naturaleza . 24 (3): 227–35. doi :10.1038/73432. PMID  10700174. S2CID  1135137.
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