Su familia ha vivido siempre en esa región desde que su bisabuelo se estableció allí durante la Gran Depresión, tras haber inmigrado desde Suecia en 1907.En la escuela secundaria jugó tres deportes: fútbol americano, baloncesto y béisbol.También trabajó regularmente en la granja familiar y en el restaurante que su madre operaba en Firebaugh.Bohl fue el único entrenador de la FBS (la máxima categoría del fútbol americano de la División I) que visitó a la familia de Josh y le dijo su padre: "Fuimos por todo el país y sólo hay un quarterback que queremos y ese es tu hijo.[12] Antes de la fecha límite del draft, Bohl le dijo a Allen que permanecer en la escuela por un año más mejoraría su preparación para la NFL.Allen también buscó consejo de Carson Wentz, quién le dijo que en el NFL, habría muchos veteranos de la liga confiando en él para "ganar los juegos y ayudar a asegurar sus trabajos.[18][19] En septiembre 12, se anunciado que Allen sería el quarterback titular contra los Chargers de Los Ángeles.[25] La semana siguiente, en un 20–13 pérdida a los Houston Texans, Allen padeció un daño de codo y no volvió.[27] Después de perderse cuatro partidos, Allen volvió contra los Jacksonville Jaguares, lo que era notable ya que Jalen Ramsey, el cornerback de los Jaguares, había llamado Allen "basura" con anterioridad a la temporada.Lideró al equipo a múltiples victorias por detrás, incluidos los New York Jets, Cincinnati Bengals, Dallas Cowboys y Pittsburgh Steelers.Los Bills lograron un lugar en los playoffs, gracias al juego mejorado de Allen y una fuerte defensa.[33] Allen y los Bills perdieron en la primera ronda de los playoffs ante los Houston Texans 22–19.Allen tuvo un desempeño similar al de la temporada pasada, logrando 36 anotaciones y 15 intercepciones[37].
