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Haplogrupo E-P2

El haplogrupo E-P2 , también conocido como E1b1 , es un haplogrupo de ADN del cromosoma Y humano . E-P2 tiene dos ramas basales, E-V38 y E-M215 . E-P2 tuvo una presencia antigua en África Oriental y el Levante ; actualmente, se distribuye principalmente en África , donde puede haberse originado, y se presenta en frecuencias más bajas en Medio Oriente y Europa .

Orígenes

Semino et al. (2004) sugirieron un origen en África Oriental afirmando: "Tanto la filogeografía como la variación de microsatélites sugieren que E-P2 y su derivado, E-M35, probablemente se originaron en África Oriental". [2]

Trombetta et al. (2011) también sugerirían un origen en África Oriental :

La nueva topología que se describe aquí tiene implicaciones importantes en cuanto a los orígenes del haplogrupo E-P2. Utilizando el principio de la parsimonia filogeográfica, la resolución de la trifurcación E-M215 a favor de un ancestro común de E-M2 y E-M329 apoya firmemente la hipótesis de que el haplogrupo E-P2 se originó en África oriental, como se sugirió anteriormente, y que los cromosomas E-M2, observados con tanta frecuencia en África subsahariana, trazan su descendencia hasta un ancestro común presente en África oriental. [3]

ADN antiguo

Se descubrió que una muestra de los restos natufienses contenía el haplogrupo E1b1 (1/5; 20%). [4]

En la cueva de Mota , en Etiopía , los restos de un antiguo varón etíope, que datan de 4500 a. C., tenían el haplogrupo paterno E1b1 y el haplogrupo materno L3x2a . [5] [6]

Distribución

Los principales subclados de E1b1 (E-P2): E1b1a (E-V38) y E1b1b (E-M215) en poblaciones dadas. [7]

En la actualidad, el E-P2 se encuentra principalmente en África , principalmente en la forma de sus subclados predominantes E-M215 y E-V38 . El E-M215 es más común en el norte de África y el Cuerno de África , y también se encuentra en frecuencias más bajas en Medio Oriente , Europa y África del Sur . El E-V38 es más común en África Occidental , África Central , África del Sur y los Grandes Lagos africanos , y se presenta en frecuencias más bajas en el norte de África y Medio Oriente.

El paraclade, denominado E-P2*, que incluye casos que no están ni en E-V38 ni en E-M215, es raro o inexistente y hasta ahora no se ha encontrado ninguno. [3]

Semino et al. (2004) encontraron E-P2 (xM35,xM2) en el 10,4% de 48 amhara etíopes , el 12,8% de 78 oromo etíopes , el 1,9% de 53 bantúes sudafricanos y el 2,9% de 139 senegaleses . [8]

Wood et al. (2005) han informado del hallazgo de E-P2(xP1, xM35) en el 11% (1/9) de una muestra de oromo de Etiopía, el 11% (1/9) de una muestra de iraquw de Tanzania, el 10% (2/20) de una muestra mixta de hablantes de varias lenguas semíticas del sur de Etiopía, el 6% (1/18) de una muestra de amhara de Etiopía, el 3% (1/30) de una muestra de ewe de Ghana, el 3% (1/32) de una muestra de fante de Ghana y el 3% (1/34) de una muestra de wolof de Gambia/Senegal. [9]

Stefflova et al. (2009) informaron que en una muestra de 199 hombres afroamericanos de Filadelfia había un individuo con E-P2 (xM35, xM2). [10]

Cruciani et al. (2002) encontraron E-P2 (xM35, xM2) en: el 18% de 22 judíos etíopes , el 2% de 49 Mossi de Burkina Faso , el 3% de 37 Rimaibe también de Burkina Faso, y el 6% de 17 Fulbe de Camerún . [11]

Semino et al. (2002) encontraron E-P2 (xM35, xM2) en el 18,2% de 88 etíopes. [12] [13]

Moran et al. (2004) encontraron E-P2 (xM35, xM2) en atletas etíopes y grupos de control e informaron los siguientes resultados: control general: 4 % (4/95), control Arsi: 8 % (7/85), 5-10K: 22 % (5/23) y atletismo: 11 % (2/11). [14]

Subclados

E-M215

El haplogrupo E-M215 es un subclado del haplogrupo E-P2. [1]

E-V38

El haplogrupo E-V38 es un subclado del haplogrupo E-P2. [1]

E-M329

Artículo principal: Haplogrupo E-M329

El haplogrupo E-M329 es un subclado del haplogrupo E-P2. [1]

Filogenética

Historia filogenética

Antes de 2002, existían en la literatura académica al menos siete sistemas de denominación para el árbol filogenético del cromosoma Y, lo que generó una considerable confusión. En 2002, los principales grupos de investigación se unieron y formaron el Consorcio del Cromosoma Y (YCC, por sus siglas en inglés). Publicaron un documento conjunto que creó un único árbol nuevo que todos acordaron utilizar. Más tarde, un grupo de científicos ciudadanos interesados ​​en la genética de poblaciones y la genealogía genética formó un grupo de trabajo para crear un árbol amateur que apuntaba a ser, sobre todo, oportuno. La siguiente tabla reúne todos estos trabajos en el punto del emblemático Árbol YCC de 2002. Esto permite que un investigador que revise la literatura publicada más antigua pueda moverse rápidamente entre nomenclaturas.

Publicaciones de investigación

Los siguientes equipos de investigación por sus publicaciones estuvieron representados en la creación del árbol YCC.

Árboles filogenéticos

Este árbol filogenético de subclados de haplogrupos se basa en el árbol YCC 2008 de Karafet (2008) [15] y en investigaciones publicadas posteriormente.

Véase también

Genética

Subclados E del ADN-Y

Árbol de la estructura principal del ADN-Y

Referencias

  1. ^ abcde "E-P177 Árbol Y".
  2. ^ ab Semino, Ornella; et al. (mayo de 2004). "Origen, difusión y diferenciación de los haplogrupos E y J del cromosoma Y: inferencias sobre la neolitización de Europa y eventos migratorios posteriores en el área mediterránea". American Journal of Human Genetics . 74 (5): 1023–1034. doi :10.1086/386295. ISSN  0002-9297. OCLC  4922408279. PMC 1181965. PMID  15069642. 17859431. 
  3. ^ abc Trombetta y otros (2011)
  4. ^ Martiniano, Rui; Sanctis, Bianca De; Hallast, Pille; Durbin, Richard (20 de diciembre de 2020). "Material complementario: colocación de secuencias de ADN antiguas en filogenias de referencia". Biología Molecular y Evolución . 39 (2): 2020.12.19.423614. bioRxiv 10.1101/2020.12.19.423614 . doi :10.1093/molbev/msac017. PMC 8857924 . PMID  35084493. S2CID  229549849.  
  5. ^ Llorente, M. Gallego; et al. (13 de noviembre de 2015). "El genoma etíope antiguo revela una extensa mezcla euroasiática en África oriental". Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID  26449472. S2CID  25743789.
  6. ^ Llorente, M. Gallego; et al. (13 de noviembre de 2015). "Materiales suplementarios: El genoma etíope antiguo revela una extensa mezcla euroasiática en África oriental" (PDF) . Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID  26449472. S2CID  25743789.
  7. ^ Badro, Danielle A.; Douaihy, Bouchra; Haber, Marc; Youhanna, Sonia C.; Salloum, Angélique; Ghassibe-Sabbagh, Michella; Johnsrud, Brian; Khazen, Georges; Matisoo-Smith, Elizabeth; Soria-Hernanz, David F.; Wells, R. Spencer; Tyler-Smith, Chris; Platt, Daniel E.; Zalloua, Pierre A.; Consortium, The Genographic (30 de enero de 2013). "La genética del cromosoma Y y del ADNmt revela contrastes significativos en las afinidades de las poblaciones modernas de Oriente Medio con las poblaciones europeas y africanas". PLOS ONE . ​​8 (1): e54616. Bibcode :2013PLoSO...854616B. doi : 10.1371/journal.pone.0054616 . Revista de  Biología Molecular y Genética  . 
  8. ^ Semino y otros (2004)
  9. ^ Madera y otros (2005)
  10. ^ Stefflova y otros (2009)
  11. ^ Cruciani y otros (2002)
  12. ^ Semino y otros (2002)
  13. ^ Underhill y otros (2000)
  14. ^ Moran y otros (2004)
  15. ^ Karafet y otros (2008)

Bibliografía

Fuentes para las tablas de conversión

Enlaces externos