familia de arqueas
Halobacteriaceae es una familia del orden Halobacteriales y del dominio Archaea . [1] Las halobacteriaceae representan una gran parte de las Archaea halófilas , junto con miembros de otras dos familias metanogénicas, Methanosarcinaceae y Methanocalculaceae . [2] La familia consta de muchos géneros diversos que pueden sobrevivir en nichos ambientales extremos. [3] Más comúnmente, las Halobacteriaceae se encuentran en lagos hipersalinos e incluso pueden tolerar sitios contaminados por metales pesados. [4] Incluyen neutrófilos , acidófilos (por ejemplo, Halarchaeum acidiphilum ), alcalófilos (por ejemplo, Natronobacterium ) e incluso se han descubierto especies psicrotolerantes (por ejemplo, Hrr. lacusprofundi ). [3] Se sabe que algunos miembros viven tanto aeróbicamente como anaeróbicamente, y vienen en muchas morfologías diferentes . [3] Estas diversas morfologías incluyen bastones en el género Halobacterium , cocos en Halococcus , discos o copas aplanados en Haloferax y otras formas que van desde triángulos aplanados en Haloarcula hasta cuadrados en Haloquadratum y Natronorubrum . [5] [6] La mayoría de las especies de Halobacteriaceae son mejor conocidas por su alta tolerancia a la sal y sus miembros pigmentados de color rojo rosado (debido a los carotenoides de bacterioruberina [5] ), pero también hay especies no pigmentadas y aquellas que requieren condiciones moderadas de sal. [3] [7] Se ha demostrado que algunas especies de Halobacteriaceae exhiben actividades solubilizantes de fósforo que contribuyen al ciclo del fósforo en ambientes hipersalinos. [8] Técnicas como el análisis de ARNr 16S y la hibridación ADN-ADN han contribuido de manera importante a la clasificación taxonómica de Halobacteriaceae, en parte debido a la dificultad en el cultivo de Archaea halófilas. [7] [3] [2]
Descripción general
Las halobacteriáceas se encuentran en agua saturada o casi saturada de sal. También se les llama halófilos , aunque este nombre también se utiliza para otros organismos que viven en agua salada algo menos concentrada. Son comunes en la mayoría de los ambientes donde hay grandes cantidades de sal, humedad y material orgánico disponibles. Las flores grandes aparecen de color rojizo, debido al pigmento bacteriorrodopsina . Este pigmento se utiliza para absorber la luz, lo que proporciona energía para crear ATP . Las halobacterias también poseen un segundo pigmento, la halorrodopsina , que bombea iones de cloruro en respuesta a los fotones, creando un gradiente de voltaje y ayudando en la producción de energía a partir de la luz. El proceso no está relacionado con otras formas de fotosíntesis que implican transporte de electrones y las halobacterias son incapaces de fijar carbono a partir de dióxido de carbono .
Las halobacterias pueden existir en ambientes salados porque aunque son aerobias , tienen una forma separada y diferente de crear energía mediante el uso de energía lumínica. Partes de las membranas de las halobacterias son de color violáceo y contienen pigmento retiniano . Esto les permite crear un gradiente de protones a través de la membrana de la célula que puede usarse para crear ATP para su propio uso.
Tienen ciertas adaptaciones para vivir en sus ambientes salados. Por ejemplo, su maquinaria celular está adaptada a altas concentraciones de sal al tener aminoácidos cargados en sus superficies, lo que permite a la célula mantener sus moléculas de agua alrededor de estos componentes. La presión osmótica y estos aminoácidos ayudan a controlar la cantidad de sal dentro de la célula. Sin embargo, debido a estas adaptaciones, si la célula se coloca en un ambiente húmedo y menos salado, es probable que explote inmediatamente debido a la presión osmótica.
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con vigencia en la nomenclatura (LPSN) [9] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [1]
Nota 1: * Halobacteriaceae parafiléticas
Nota 2: Halobacteriaceae no asignadas
- " Actinoarchaeum " Tang et al. 2023
- " Haloalcalophilium " Lizama et al. 2000a
- " Halorarius " Sun et al. 2023
Ver también
Referencias
- ^ ab Sayers; et al. "Halobacterias". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 15 de agosto de 2023 .
- ^ ab Oren, Aharon (septiembre de 2014). "Taxonomía de Archaea halófilas: estado actual y desafíos futuros". Extremófilos . 18 (5): 825–834. doi :10.1007/s00792-014-0654-9. PMID 25102811. S2CID 5395569.
- ^ abcde Oren, Aharon (1 de febrero de 2012). "Taxonomía de la familia Halobacteriaceae: un paradigma para cambiar conceptos en la sistemática de procariotas". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . PMID 22155757.
- ^ Naik, Sanika; Furtado, Irene (2017). Contaminación marina y remediación microbiana . Singapur: Springer Nature. págs. 143-152. ISBN 978-981-10-1044-6.
- ^ ab Oren, Aharon; Arahal, David; Ventosa, Antonio (2009). "Descripciones modificadas de géneros de la familia Halobacteriaceae". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 59 (3): 637–642. doi : 10.1099/ijs.0.008904-0 . PMID 19244452.
- ^ Tully, Benjamín; Emerson, Joanne; Andrade, Karen; Brocks, Jochen; Allen, Eric; Banfield, Jillian; Heidelberg, Karla (16 de septiembre de 2014). "Las secuencias de novo de Haloquadratum walsbyi del lago Tyrrell, Australia, revelan un paisaje genómico variable". Arqueas . 2015 : 875784. doi : 10.1155/2015/875784 . PMC 4330952 . PMID 25709557.
- ^ ab Ventosa, A.; Márquez, M.; Sánchez-Porro, C.; Haba, R. (2012). Avances en la comprensión de la biología de los microorganismos halófilos ([Ed. actualizado]. ed.). Dordrecht: Springer, Dordrecht. doi :10.1007/978-94-007-5539-0_3. ISBN 978-94-007-5538-3.
- ^ Yadav, entreabierto Nath; Sharma, Divya; Gulati, Sneha; Singh, Surender; Dey, Rinku; Pal, Kamal Krishna; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil Kumar (28 de julio de 2015). "Haloarchaea dotada del atributo de solubilización de fósforo implicado en el ciclo del fósforo". Informes científicos . 5 (1): 12293. Código bibliográfico : 2015NatSR...512293Y. doi :10.1038/srep12293. PMC 4516986 . PMID 26216440.
- ^ JP Euzéby. "Halobacterias". Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 15 de agosto de 2023 .
- ^ "El LTP" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
- ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
- ^ "Notas de la versión LTP_08_2023" (PDF) . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
- ^ "Versión GTDB 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
Otras lecturas
Revistas científicas
- Wright, ADG (2006). "Relaciones filogenéticas dentro del orden Halobacteriales inferidas a partir de secuencias del gen 16S rRNA". En t. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 56 (Parte 6): 1223–1227. doi : 10.1099/ijs.0.63776-0 . PMID 16738095.
- Judicial, Comisión del Comité Internacional de Sistemática de Procariotas (2005). "Los tipos de nomenclatura de los órdenes Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobianes, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales y Verrucomicrobianos son los géneros Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Procloron, Sulfolobus. , Thermococcus, Thermoproteus y Verrucomicrobium, respectivamente. Opinión 79". En t. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 55 (Parte 1): 517–518. doi : 10.1099/ijs.0.63548-0 . PMID 15653928.
- Euzeby JP, Tindall BJ (2001). "Tipos de nomenclatura de órdenes: correcciones necesarias según las reglas 15 y 21a del Código Bacteriológico (Revisión de 1990), y designación de tipos de nomenclatura apropiados de clases y subclases. Solicitud de opinión". En t. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 51 (Parte 2): 725–727. doi : 10.1099/00207713-51-2-725 . PMID 11321122.
- Oren A, Ventosa A (2000). "Subcomité del Comité Internacional de Bacteriología Sistemática sobre taxonomía de Halobacteriaceae. Actas de las reuniones, 16 de agosto de 1999, Sydney, Australia". En t. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 50 (3): 1405-1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089.
Libros científicos
- Grant WD, Larsen H (1989). "Grupo III. Arqueobacterias extremadamente halófilas. Orden Halobacteriales ord. nov.". En JT Staley, MP Bryant, N Pfennig, JG Holt (eds.). Manual de bacteriología sistemática de Bergey, volumen 3 (1ª ed.). Baltimore: Williams & Wilkins Co. pág. 169.
- Gibbons, NE (1974). "Familia V. Halobacteriaceae familia nov". En RE Buchanan y NE Gibbons (ed.). Manual de bacteriología determinativa de Bergey (8ª ed.). Baltimore: Williams & Wilkins Co.
- Blum P, ed. (2008). Archaea: nuevos modelos para la biología procariótica. Prensa académica Caister . ISBN 978-1-904455-27-1. [1].
enlaces externos
- Nombres correctos de taxones dentro de la familia Halobacteriaceae.