Halorubrum lacusprofundi

Especies de arqueón

Halorubrum lacusprofundi es un arqueón halófilo con forma de varillade la familia de las Halorubraceae . Fue aislado por primera vez en Deep Lake en la Antártida en la década de 1980. ^[3]

genoma

Se han descubierto varias cepas de H. lacusprofundi . La secuenciación del genoma de la cepa ACAM 32 se completó en 2008. El genoma del organismo consta de dos cromosomas circulares y un único plásmido circular . El cromosoma I contiene 2.735.295 pares de bases que codifican 2.801 genes y el cromosoma II contiene 525.943 pares de bases que codifican 522 genes. El único plásmido contiene 431.338 pares de bases que codifican 402 genes. ^[4] Al menos una cepa de H. lacusprofundi (R1S1) contiene un plásmido (pR1SE) que permite la transferencia horizontal de genes , que se lleva a cabo mediante un mecanismo que utiliza partículas similares a virus encerradas en vesículas . ^{[5] [6] [7]}

Investigación

Su enzima β-galactosidasa se ha estudiado ampliamente para comprender cómo funcionan las proteínas en ambientes de baja temperatura y alto contenido salino. ^{[8] [9]}

Referencias

1. Especies de página : Halorubrum lacusprofundi en "LPSN - Lista de nombres procariotas destacados en la nomenclatura". Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen . Consultado el 10 de septiembre de 2022 .
2. Navegador de taxonomía de páginas (Halorubrum lacusprofundi) en "NCBI" . Consultado el 10 de septiembre de 2022 .
3. Franzmann PD, Stacklebrandt E, Sanderson K, Volkman JK, Camberon DE, Stevenson PL, McMeekin TA, Burton HR (1988). " Halobacterium lacusprofundii sp. nov., una bacteria halófila aislada de Deep Lake, Antártida". Microbiología Sistemática y Aplicada . 11 (1): 20–27. doi :10.1016/S0723-2020(88)80044-4.
4. Anderson IJ, DasSarma P, Lucas S, Copeland A, Lapidus A, Del Rio T, Tice H, Dalin E, Bruce DC, Goodwin L, Pitluck S, Sims D, Brettin TS, Detter JC, Han CS, Larimer F, Hauser L, Land M, Ivanova N, Richardson P, Cavicchioli R, DasSarma S, Woese CR, Kyrpides (2016). "Secuencia completa del genoma de la cepa tipo ACAM 34 de Halorubrum lacusprofundi antártico". Estándares en Ciencias Genómicas . 11 (1): 70. doi : 10.1186/s40793-016-0194-2 . PMC 5018182 . PMID  27617060. 
5. Erdmann S, Tschitschko B, Zhong L, Raftery MJ, Cavicchioli R (9 de septiembre de 2017). "Un plásmido de un haloarqueón antártico utiliza vesículas de membrana especializadas para diseminar e infectar células libres de plásmidos". Microbiología de la naturaleza . 2 (10): 1446-1455. doi :10.1038/s41564-017-0009-2. PMID  28827601. S2CID  38729395.
6. Gophna U, Altman-Price N (8 de septiembre de 2022). "Transferencia horizontal de genes en Archaea: desde los mecanismos hasta la evolución del genoma". Revista Anual de Microbiología . 76 (1): 481–502. doi : 10.1146/annurev-micro-040820-124627 . ISSN  0066-4227.
7. Gebhard LJ, Vershinin Z, Alarcón-Schumacher T, Eichler J, Erdmann S (junio de 2023). "Influencia de la N-glicosilación en las interacciones virus-huésped en Halorubrum lacusprofundi". Virus . 15 (7): 1469. doi : 10.3390/v15071469 . PMC 10384203 . PMID  37515157. 
8. Karan R, Capes MD, DasSarma P, DasSarma S (2013). "Clonación, sobreexpresión, purificación y caracterización de una β-galactosidasa poliextremófila del Haloarchaeon antártico Halorubrum lacusprofundi". BMC Biotecnología . 13 : 10.1186/1472-6750-13-3. doi : 10.1186/1472-6750-13-3 . PMC 3556326 . PMID  23320757. 
9. Laye VJ, Karan R, Kim JM, Pecher WT, DasSarma P, DasSarma S (2017). "Residuos de aminoácidos clave que confieren una mayor actividad enzimática a temperaturas frías en una β-galactosidasa poliextremófila antártica". PNAS . 114 (47): 12530–35. Código Bib : 2017PNAS..11412530L. doi : 10.1073/pnas.1711542114 . PMC 5703305 . PMID  29109294.