stringtranslate.com

Geraniltranstransferasa

En enzimología , una geraniltranstransferasa ( EC 2.5.1.10) es una enzima que cataliza la reacción química.

difosfato de geranilo + difosfato de isopentenilo difosfato + difosfato de trans,trans-farnesilo

Por tanto, los dos sustratos de esta enzima son difosfato de geranilo (un precursor de 10 carbonos) y difosfato de isopentenilo (un precursor de 5 carbonos), mientras que sus dos productos son difosfato y trans,transfarnesil difosfato (un producto de 15 carbonos). [1]

Esta enzima pertenece a la familia de las transferasas , concretamente a las que transfieren grupos arilo o alquilo distintos de los grupos metilo.

Nomenclatura

El nombre sistemático de esta clase de enzimas es geranil-difosfato: isopentenil-difosfato geraniltranstransferasa. Otros nombres de uso común incluyen:

Las abreviaturas comunes incluyen: FPS, FDS, FPPS y FDPS.

Estructura

La estructura y el mecanismo de la farnesil pirofosfato sintasa (FPPS), un tipo de geraniltranstransferasa, están bien caracterizados. La FPPS es una enzima homodimérica dependiente de Mg 2+ de ~30 kDa que sintetiza (E, E)-farnesil pirofosfato de manera sucesiva a partir de dos equivalentes de isopentenil pirofosfato (IPP) y dimetilalil pirofosfato (DMAPP). [2]

Estructura cristalina de FPPS (PDB ID: 1RQI)
Estructura cristalina del homodímero de FPPS con IPP y análogo de DMAPP, DMSPP (PDB ID: 1RQI). Los monómeros se muestran en magenta y azul oscuro. Los residuos en la bolsa hidrofóbica están resaltados en amarillo. La base de la bolsa está formada por el residuo verde (una fenilalanina). En el recuadro 1 se muestra una estructura de monómero girada 90 grados para resaltar la bolsa hidrofóbica. En el recuadro 2 se muestra una vista superior del sitio activo junto con el centro catalítico trinuclear de Mg 2+ (esferas de plata) mediado por aspartato. [2] Imágenes generadas en PyMOL .

FPPS adopta un pliegue helicoidal α de 3 capas característico de muchas preniltransferasas con 11 hélices y bucles flexibles en el medio. Las hélices ubicadas centralmente (α4 y α8) contienen motivos de aspartato conservados (DDXXD) que participan en la unión del sustrato y la catálisis. [3] Los residuos de aspartato, los oxígenos del agua y el pirofosfato coordinan tres Mg 2+ de forma octaédrica. El complejo trinuclear Mg 2+ es fundamental para unirse a DMAPP y estabilizar el grupo saliente pirofosfato mientras la cola de hidrocarburo en crecimiento se encaja en una bolsa hidrófoba profunda. [2] Los estudios de mutagénesis dirigida han demostrado que la longitud final del producto isoprenoide está determinada por residuos voluminosos (a menudo fenilalanina) en la base de la bolsa hidrófoba. [4]

Mecanismo

A partir de estructuras cristalinas y ensayos cinéticos, se cree que FPPS cataliza la reacción de condensación en tres pasos concertados: (1) ionización, (2) condensación y (3) eliminación. [2]

En el primer paso, tres Mg 2+ estabilizan el grupo saliente aniónico, pirofosfato, en pirofosfato de dimetilalilo (DMAPP). La pérdida de pirofosfato forma el catión dimetilalilo. En el segundo paso, el doble enlace C3-C5 reactivo del pirofosfato de isopentilo (IPP) realiza un ataque nucleofílico sobre el catión dimetilalilo formado previamente. El paso final implica que el pirofosfato retenido en el centro trinuclear Mg 2+ actúe como base catalítica en una reacción de eliminación para formar pirofosfato de geranilo. Una segunda ronda consecutiva de ionización de pirofosfato de geranilo, condensación con IPP y eliminación forma pirofosfato de farnesilo. [2] [5]

Función

Las geraniltranstransferasas son una clase de enzimas conservadas evolutivamente en Archaea, Bacteria y Eukarya que participan en una amplia gama de vías biosintéticas que incluyen las del colesterol , la porfirina , los carotenoides , la ubiquinona y los isoprenoides . [3] Varios estudios han localizado el FPPS en cloroplastos, mitocondrias, citosol y peroxisomas. [6] [7] [8]

Vías biosintéticas de FPPS
La FPPS, una geraniltranstransferasa, cataliza reacciones (mostradas con flechas rojas) centrales para muchas vías biosintéticas. [6]

En la síntesis de colesterol, el producto, el pirofosfato de farnesilo, se consume en una condensación reductora de cola con cola con otro pirofosfato de farnesilo para formar un compuesto de 30 carbonos llamado escualeno por la escualeno sintasa . [9] A través de varios pasos biosintéticos más, el escualeno se transforma en lanosterol , un precursor directo del colesterol. [10] En particular, los esteroles controlan la expresión de FPPS a través de dos factores reguladores cis (una caja CAAT invertida y SRE-3) en el promotor proximal de FPPS. [11] En las plantas, la porfirina y los carotenoides constituyen pigmentos accesorios que ayudan a capturar la luz en los fotosistemas . La ubiquinona es un transportador de electrones clave en la cadena de transporte de electrones de la respiración celular . Los isoprenoides son un gran grupo de compuestos que sirven como precursores biosintéticos de lípidos y hormonas . [6]

El farnesilo y el pirofosfato de geranilo también sirven como precursores de las proteínas preniladas. La prenilación es un tipo común de modificación postraduccional covalente en motivos CaaX C-terminales que permite que las proteínas se ubiquen en las membranas o se unan entre sí. Un ejemplo notable de lo primero es la farnesilación de pequeñas proteínas G, incluidas Ras , CDC42 , Rho y Rac. La unión de una cadena alifática hidrófoba como las presentes en los grupos farnesilo o geranilgeranilo permite que las pequeñas proteínas G se unan a las membranas y lleven a cabo funciones efectoras. [12]

Orientación de medicamentos

El FPPS es el objetivo de los bifosfonatos como Fosamax ( alendronato ) y Actonel ( risedronato ). Los bisfosfonatos se recetan comúnmente para enfermedades óseas, incluida la enfermedad de Paget , las metástasis osteolíticas y la osteoporosis posmenopáusica . Los bisfosfonatos ayudan a mantener el tejido óseo en pacientes osteoporóticos y reducen los niveles de calcio en sangre en pacientes hipercalcémicos al inhibir la FPPS en los osteoclastos que reabsorben el hueso . Un complejo ternario FPPS-IPP-risendronato demostró que el risendronato se une al complejo trinuclear Mg 2+ e interactúa con la bolsa hidrofóbica de una manera similar a DMAPP. [2] [13]

Referencias

  1. ^ Lynen F, Agranoff BW, Eggerer H, Henning U, Möslein EM (1959). "Zur Biosynthese der Terpene. VI gamma, gamma-Dimetil-alil-pirofosfato und Geranil-pirofosfato, biológico Vorstufen des Squalens". Angélica. química . 71 (21): 657–663. doi : 10.1002/ange.19590712102.
  2. ^ abcdef Hosfield DJ, Zhang Y, Dougan DR, Broun A, Tari LW, Swanson RV, Finn J (marzo de 2004). "Base estructural para la inhibición de la biosíntesis de isoprenoides mediada por bifosfonatos". La Revista de Química Biológica . 279 (10): 8526–9. doi : 10.1074/jbc.C300511200 . PMID  14672944.
  3. ^ ab Chen A, Kroon PA, Poulter CD (abril de 1994). "Isoprenil difosfato sintasas: comparaciones de secuencias de proteínas, un árbol filogenético y predicciones de estructura secundaria". Ciencia de las proteínas . 3 (4): 600–7. doi :10.1002/pro.5560030408. PMC 2142870 . PMID  8003978. 
  4. ^ Tarshis LC, Proteau PJ, Kellogg BA, Sacchettini JC, Poulter CD (diciembre de 1996). "Regulación de la longitud de la cadena del producto mediante isoprenil difosfato sintasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 93 (26): 15018–23. Código bibliográfico : 1996PNAS...9315018T. doi : 10.1073/pnas.93.26.15018 . PMC 26348 . PMID  8986756. 
  5. ^ Tarshis LC, Yan M, Poulter CD, Sacchettini JC (septiembre de 1994). "Estructura cristalina de la farnesil difosfato sintasa recombinante con una resolución de 2,6 A". Bioquímica . 33 (36): 10871–7. doi :10.1021/bi00202a004. PMID  8086404.
  6. ^ abc Dhar MK, Koul A, Kaul S (enero de 2013). "Farnesil pirofosfato sintasa: una enzima clave en la vía biosintética de isoprenoides y posible objetivo molecular para el desarrollo de fármacos". Nueva Biotecnología . 30 (2): 114–23. doi :10.1016/j.nbt.2012.07.001. PMID  22842101.
  7. ^ Sanmiya K, Ueno O, Matsuoka M, Yamamoto N (marzo de 1999). "Localización de farnesil difosfato sintasa en cloroplastos". Fisiología vegetal y celular . 40 (3): 348–54. doi : 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029549. PMID  10353221.
  8. ^ Martín D, Piulachs MD, Cunillera N, Ferrer A, Bellés X (marzo de 2007). "La focalización mitocondrial de la farnesil difosfato sintasa es un fenómeno generalizado en eucariotas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Investigación de células moleculares . 1773 (3): 419–26. doi :10.1016/j.bbamcr.2006.11.015. PMID  17198737.
  9. ^ Tansey TR, Shechter I (2001). "Escualeno sintasa: estructura y regulación". Prog. Res de ácido nucleico. Mol. Biol . Avances en la investigación de ácidos nucleicos y biología molecular. 65 : 157–95. doi :10.1016/S0079-6603(00)65005-5. ISBN 9780125400657. PMID  11008488.
  10. ^ Liang PH, Ko TP, Wang AH (2002). "Estructura, mecanismo y función de las preniltransferasas". EUR. J. Bioquímica . 269 ​​(14): 3339–54. doi :10.1046/j.1432-1033.2002.03014.x. PMID  12135472.
  11. ^ Ericsson J, Jackson SM, Edwards PA (octubre de 1996). "La unión sinérgica de la proteína de unión al elemento regulador de esteroles y NF-Y al promotor de la farnesil difosfato sintasa es fundamental para la expresión del gen regulada por esteroles". La Revista de Química Biológica . 271 (40): 24359–64. doi : 10.1074/jbc.271.40.24359 . PMID  8798690.
  12. ^ Sebti SM (abril de 2005). "Farnesilación de proteínas: implicaciones para la fisiología normal, la transformación maligna y la terapia del cáncer". Célula cancerosa . 7 (4): 297–300. doi : 10.1016/j.ccr.2005.04.005 . PMID  15837619.
  13. ^ Guo RT, Cao R, Liang PH, Ko TP, Chang TH, Hudock MP, Jeng WY, Chen CK, Zhang Y, Song Y, Kuo CJ, Yin F, Oldfield E, Wang AH (junio de 2007). "Los bifosfonatos se dirigen a múltiples sitios en las cis y transpreniltransferasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (24): 10022–7. Código Bib : 2007PNAS..10410022G. doi : 10.1073/pnas.0702254104 . PMC 1877987 . PMID  17535895.