La empresa actualmente tiene sus oficinas en Maple Leaf, cerca de Seattle, Washington, Estados Unidos.Fantagraphics fue fundada en 1976 por Gary Groth y Michael Catron en College Park, Maryland, Estados Unidos.La editorial adquirió el zine The Nostalgia Journal, que fue renombrado a The Comics Journal y más tarde se convertiría en una publicación notable sobre la industria de la historieta.Groth y Thomson reconocen el trabajo de Reynolds como clave para que la editorial lograra ser redituable.[18][19] En 2020 la editorial cambia su identidad, de Fantagraphics Books as Fantagraphics, para reflejar que también publica ediciones digitales, al mismo tiempo que introdujo un logotipo más compacto, mostrando una plumilla y una antorcha.
El stand de Fantagraphics en la Stumpton Comics Fest 2006.
