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Euryarqueota

Euryarchaeota (del griego antiguo εὐρύς eurús, "amplio, ancho") es un filo de archaea . [3] Los euryarchaeota son muy diversos e incluyen metanógenos , que producen metano y se encuentran a menudo en los intestinos; halobacterias , que sobreviven a concentraciones extremas de sal ; y algunos aerobios y anaerobios extremadamente termófilos , que generalmente viven a temperaturas entre 41 y 122 °C. Están separados de los otros arcaicos basándose principalmente en secuencias de ARNr y su ADN polimerasa única. [4]

Descripción

Los Euryarchaeota son diversos en apariencia y propiedades metabólicas. El filo contiene organismos de diversas formas, incluidos bastones y cocos . Euryarchaeota puede aparecer como grampositivo o gramnegativo dependiendo de si hay pseudomureína presente en la pared celular. [5] Euryarchaeota también demuestra diversos estilos de vida, incluidos metanógenos, halófilos, reductores de sulfato y termófilos extremos en cada uno. [5] Otros viven en el océano, suspendidos con plancton y bacterias. Aunque estos euryarchaeota marinos son difíciles de cultivar y estudiar en un laboratorio, la secuenciación genómica sugiere que son heterótrofos móviles . [6]

Aunque anteriormente se pensaba que los euryarchaeota solo vivían en ambientes extremos (en términos de temperatura, contenido de sal y/o pH), un artículo de Korzhenkov et al publicado en enero de 2019 mostró que los euryarchaeota también viven en ambientes moderados, como los de baja temperatura. ambientes ácidos. En algunos casos, euryarchaeota superaba en número a las bacterias presentes. [7] Euryarchaeota también se ha encontrado en otros ambientes moderados como manantiales de agua, marismas, suelos y rizosferas . [8] Algunos euryarchaeota son muy adaptables; Un orden llamado Halobacteriales generalmente se encuentra en ambientes extremadamente salados y ricos en azufre, pero también puede crecer en concentraciones de sal tan bajas como la del agua de mar (2,5%). [8] En las rizosferas, la presencia de euryarchaeota parece depender de la de los hongos micorrízicos ; una mayor población de hongos se correlacionó con una mayor frecuencia y diversidad de euryarchaeotas, mientras que la ausencia de hongos micorrízicos se correlacionó con la ausencia de euryarchaeota. [8]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con estatus en la nomenclatura (LPSN) [9] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [10].

Una tercera filogenia, 53 proteínas marcadoras basadas en GTDB 08-RS214. [17] [18] [19]

Ver también

Referencias

  1. ^ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (junio de 1990). "Hacia un sistema natural de organismos: propuesta para los dominios Archaea, Bacteria y Eucarya". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 87 (12): 4576–9. Código bibliográfico : 1990PNAS...87.4576W. doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . PMC  54159 . PMID  2112744.
  2. ^ Castelle CJ, Banfield JF (2018). "Importantes grupos microbianos nuevos amplían la diversidad y alteran nuestra comprensión del árbol de la vida". Celúla . 172 (6): 1181-1197. doi : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . PMID  29522741.
  3. ^ Hogan CM (2010). E. Monosson, C. Cleveland (eds.). "Arqueas". Enciclopedia de la Tierra . Consejo Nacional para la Ciencia y el Medio Ambiente . Consultado el 18 de agosto de 2017 .
  4. ^ Lincoln SA, Wai B, Eppley JM, Church MJ, Summons RE, DeLong EF (julio de 2014). "La Euryarchaeota planctónica es una fuente importante de lípidos tetraéter de arqueas en el océano". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 111 (27): 9858–63. Código Bib : 2014PNAS..111.9858L. doi : 10.1073/pnas.1409439111 . PMC 4103328 . PMID  24946804. 
  5. ^ ab Garrity GM, Holt JG (2015). "Euryarchaeota phy. Nov.". En Whitman WB (ed.). Manual de sistemática de arqueas y bacterias de Bergey . John Wiley e hijos . doi :10.1002/9781118960608. ISBN 9781118960608.
  6. ^ Iverson V, Morris RM, Frazar CD, Berthiaume CT, Morales RL, Armbrust EV (febrero de 2012). "Desenredar genomas de metagenomas: revelar una clase inculta de Euryarchaeota marina". Ciencia . 335 (6068): 587–90. Código Bib : 2012 Ciencia... 335..587I. doi : 10.1126/ciencia.1212665. PMID  22301318. S2CID  31381073.
  7. ^ Korzhenkov AA, Toshchakov SV, Bargiela R, Gibbard H, Ferrer M, Teplyuk AV, Jones DL, Kublanov IV, Golyshin PN, Golyshina OV (enero de 2019). "Las arqueas dominan la comunidad microbiana en un ecosistema con temperatura baja a moderada y acidez extrema". Microbioma . 7 (1): 11. doi : 10.1186/s40168-019-0623-8 . PMC 6350386 . PMID  30691532. 
  8. ^ abc Bomberg M, Timonen S (octubre de 2007). "Distribución de cren- y euryarchaeota en micorrizosferas de pino silvestre y humus de bosques boreales". Ecología microbiana . 54 (3): 406–16. doi :10.1007/s00248-007-9232-3. PMID  17334967. S2CID  19425171.
  9. ^ Euzéby JP. "Euriarqueota". Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN). Archivado desde el original el 9 de agosto de 2017 . Consultado el 9 de agosto de 2017 .
  10. ^ Repetidores; et al. "Euriarqueota". Navegador de taxonomía . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 9 de agosto de 2017 .
  11. ^ "El LTP" . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  12. ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  13. ^ "Notas de la versión LTP_12_2021" (PDF) . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  14. ^ ab Nina Dombrowski, Jun-Hoe Lee, Tom A Williams, Pierre Offre, Anja Spang (2019). Diversidad genómica, estilos de vida y orígenes evolutivos de las arqueas DPANN. Naturaleza.
  15. ^ ab Jordan T. Bird, Brett J. Baker, Alexander J. Probst, Mircea Podar, Karen G. Lloyd (2017). Las comparaciones genómicas independientes de cultivos revelan adaptaciones ambientales para Altiarchaeales. Fronteras.
  16. ^ ab Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). "Árboles de proteínas ribosómicas multidominio y el origen planctobacteriano de neomura (eucariotas, arqueobacterias)". Protoplasma . 257 (3): 621–753. doi :10.1007/s00709-019-01442-7. PMC 7203096 . PMID  31900730. 
  17. ^ "Versión GTDB 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 6 de diciembre de 2021 .
  18. ^ "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  19. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 6 de diciembre de 2021 .
  20. ^ Anja Spang, Eva F. Caceres, Thijs JG Ettema: Exploración genómica de la diversidad, ecología y evolución del dominio arqueal de la vida. En: Science Volumen 357 Número 6351, eaaf3883, 11 de agosto de 2017, doi:10.1126/science.aaf3883
  21. ^ Algunos mal escritos como Theinoarchaea: Catherine Badel, Gaël Erauso, Annika L. Gomez, Ryan Catchpole, Mathieu Gonnet, Jacques Oberto, Patrick Forterre, Violette Da Cunha: La distribución global y la historia evolutiva de la familia de plásmidos arqueales pT26-2. En: microbiología ambiental. sfam 10 de septiembre de 2019. doi:10.1111/1462-2920.14800
  22. ^ NCBI: Candidatus Poseidoniia (clase)

Otras lecturas

enlaces externos

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