La coenzima Q: citocromo c – oxidorreductasa , a veces llamada complejo citocromo bc 1 , y otras veces complejo III , es el tercer complejo en la cadena de transporte de electrones ( EC 1.10.2.2), desempeñando un papel crítico en la generación bioquímica de ATP ( fosforilación oxidativa ). El complejo III es una proteína transmembrana de múltiples subunidades codificada tanto por el genoma mitocondrial ( citocromo b ) como por el nuclear (todas las demás subunidades). El complejo III está presente en las mitocondrias de todos los animales y de todos los eucariotas aeróbicos y en las membranas internas de la mayoría de las eubacterias . Las mutaciones en el Complejo III provocan intolerancia al ejercicio y trastornos multisistémicos. El complejo bc1 contiene 11 subunidades, 3 subunidades respiratorias (citocromo B, citocromo C1, proteína de Rieske), 2 proteínas centrales y 6 proteínas de bajo peso molecular .
Ubiquinol: la citocromo-c reductasa cataliza la reacción química
QH 2 + 2 ferricitocromo c Q + 2 ferrocitocromo c + 2 H +
Así, los dos sustratos de esta enzima son el quinol (QH 2 ) y el ferri- (Fe 3+ ) citocromo c , mientras que sus 3 productos son la quinona (Q), el ferro- (Fe 2+ ) citocromo c y el H + .
El nombre sistemático de esta clase de enzimas es ubiquinol: ferricitocromo-c oxidorreductasa . Otros nombres de uso común incluyen:
Estructura
Estructura del complejo III (haga clic para ampliar)
En comparación con las otras subunidades principales de la cadena de transporte de electrones que bombean protones , el número de subunidades encontradas puede ser pequeño, tan pequeño como tres cadenas polipeptídicas. Este número aumenta y en los animales superiores se encuentran once subunidades. [2] Tres subunidades tienen grupos protésicos . La subunidad del citocromo b tiene dos hemo de tipo b ( b L y b H ), la subunidad del citocromo c tiene un hemo de tipo c ( c 1 ) y la subunidad de proteína de hierro y azufre (ISP) de Rieske tiene dos grupos de hierro y dos de azufre. cluster hierro-azufre (2Fe·2S).
En los vertebrados, el complejo bc 1 , o Complejo III, contiene 11 subunidades: 3 subunidades respiratorias, 2 proteínas centrales y 6 proteínas de bajo peso molecular. [3] [4] Los complejos proteobacterianos pueden contener tan solo tres subunidades. [5]
Tabla de composición de subunidades del complejo III.
a En los vertebrados, un producto de escisión de 8 kDa del extremo N de la proteína de Rieske ( péptido señal ) se retiene en el complejo como subunidad 9. Por tanto, las subunidades 10 y 11 corresponden a QCR9p y QCR10p de hongos.
Reacción
Ilustración esquemática de reacciones del complejo III.
Cataliza la reducción del citocromo c por oxidación de la coenzima Q (CoQ) y el bombeo concomitante de 4 protones desde la matriz mitocondrial al espacio intermembrana:
QH 2 + 2 citocromo c (Fe III ) + 2 H+ en→ Q + 2 citocromo c (Fe II ) + 4 H+ fuera
En el proceso llamado ciclo Q , [6] [7] se consumen dos protones de la matriz (M), se liberan cuatro protones al espacio intermembrana (IM) y se pasan dos electrones al citocromo c .
Mecanismo de reacción
El ciclo Q
El mecanismo de reacción del complejo III (citocromo bc1, coenzima Q: citocromo C oxidorreductasa) se conoce como ciclo de la ubiquinona ("Q"). En este ciclo, se liberan cuatro protones en el lado positivo "P" (espacio entre membranas), pero sólo dos protones se absorben en el lado negativo "N" (matriz). Como resultado, se forma un gradiente de protones a través de la membrana. En la reacción general, dos ubiquinoles se oxidan a ubiquinonas y una ubiquinona se reduce a ubiquinol . En el mecanismo completo, se transfieren dos electrones del ubiquinol a la ubiquinona, a través de dos intermediarios del citocromo c.
En general :
2 x QH 2 oxidado a Q
1 x Q reducido a QH 2
2 x Cyt c reducido
4 x H + liberados al espacio intermembrana
2 x H + recogido de la matriz
La reacción transcurre según los siguientes pasos:
La ronda 1 :
El citocromo b se une a un ubiquinol y una ubiquinona.
El centro 2Fe/2S y el hemo B L extraen cada uno un electrón del ubiquinol unido, liberando dos protones en el espacio intermembrana.
Un electrón se transfiere al citocromo c 1 desde el centro 2Fe/2S, mientras que otro se transfiere del hemo B L al hemo B H.
El citocromo c 1 transfiere su electrón al citocromo c (que no debe confundirse con el citocromo c1), y el BH Heme transfiere su electrón a una ubiquinona cercana, lo que da como resultado la formación de una ubisemiquinona.
El citocromo c se difunde. El primer ubiquinol (ahora oxidado a ubiquinona) se libera, mientras que la semiquinona permanece unida.
La ronda 2 :
Un segundo ubiquinol está unido al citocromo b.
El centro 2Fe/2S y el hemo B L extraen cada uno un electrón del ubiquinol unido, liberando dos protones en el espacio intermembrana.
Un electrón se transfiere al citocromo c 1 desde el centro 2Fe/2S, mientras que otro se transfiere del hemo B L al hemo B H.
Luego, el citocromo c 1 transfiere su electrón al citocromo c , mientras que la semiquinona cercana producida en la ronda 1 recoge un segundo electrón del hemo BH , junto con dos protones de la matriz.
Se libera el segundo ubiquinol (ahora oxidado a ubiquinona), junto con el ubiquinol recién formado. [8]
Inhibidores del complejo III
Hay tres grupos distintos de inhibidores del complejo III.
La antimicina A se une al sitio Qi e inhibe la transferencia de electrones en el Complejo III desde el hemo b H al Q oxidado (inhibidor del sitio Qi).
El mixotiazol y la estigmatelina se unen al sitio Q o e inhiben la transferencia de electrones del QH 2 reducido a la proteína de azufre Rieske Iron. El mixotiazol y la estigmatelina se unen a bolsas distintas pero superpuestas dentro del sitio Q o .
El mixotiazol se une más cerca del citocromo bL (de ahí que se denomine inhibidor " proximal ").
La estigmatelina se une más lejos del hemo bL y más cerca de la proteína de azufre Rieske Iron, con la que interactúa fuertemente.
Una pequeña fracción de electrones abandona la cadena de transporte de electrones antes de llegar al complejo IV . La fuga prematura de electrones al oxígeno da como resultado la formación de superóxido . La relevancia de esta reacción secundaria, que de otro modo sería menor, es que el superóxido y otras especies reactivas de oxígeno son altamente tóxicos y se cree que desempeñan un papel en varias patologías, así como en el envejecimiento (la teoría del envejecimiento de los radicales libres ). [ 10] La fuga de electrones se produce principalmente en el sitio Q o y es estimulada por la antimicina A. La antimicina A bloquea los hemos b en el estado reducido evitando su reoxidación en el sitio Qi , lo que, a su vez, hace que aumenten las concentraciones en estado estacionario de la semiquinona Q o , reaccionando esta última especie con el oxígeno para formar superóxido. . Se cree que el efecto del alto potencial de membrana tiene un efecto similar. [11] El superóxido producido en el sitio Qo puede liberarse tanto en la matriz mitocondrial [12] [13] como en el espacio intermembrana, donde luego puede alcanzar el citosol. [12] [14] Esto podría explicarse por el hecho de que el Complejo III podría producir superóxido como HOO • permeable a la membrana en lugar de O impermeable a la membrana.−. 2. [13]
Nombres de genes humanos
MT-CYB : citocromo b codificado por ADNmt ; Mutaciones asociadas con la intolerancia al ejercicio.
TTC19 : subunidad recientemente identificada, mutaciones relacionadas con la deficiencia nuclear tipo 2 del complejo III. Ayuda a eliminar el fragmento N-terminal de UQCRFS1, que de otro modo interferiría con la función del complejo III. [15]
Mutaciones en genes del complejo III en enfermedades humanas
Las mutaciones en genes relacionados con el complejo III generalmente se manifiestan como intolerancia al ejercicio. [16] [17] Se ha informado que otras mutaciones causan displasia septoóptica [18] y trastornos multisistémicos. [19] Sin embargo, las mutaciones en BCS1L , un gen responsable de la maduración adecuada del complejo III, pueden provocar el síndrome de Björnstad y el síndrome GRACILE , que en los recién nacidos son afecciones letales que tienen manifestaciones multisistémicas y neurológicas que tipifican trastornos mitocondriales graves. La patogenicidad de varias mutaciones se ha verificado en sistemas modelo como la levadura. [20]
Actualmente se desconoce en qué medida estas diversas patologías se deben a déficits bioenergéticos o a una sobreproducción de superóxido .
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enlaces externos
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Modelo molecular interactivo del Complejo III en Wayback Machine (archivado el 12 de enero de 2009) (Requiere MDL Chime)
Orientación UMich de proteínas en familias de membranas/superfamilia-3 : posiciones calculadas de bc1 y complejos relacionados en membranas