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Cristóbal Dessimoz

Christophe Dessimoz es profesor de la Fundación Nacional Suiza de Ciencias (SNSF) en la Universidad de Lausana , profesor asociado en el University College de Londres y líder de grupo en el Instituto Suizo de Bioinformática . [5] [2] [6] [7] [8] Fue galardonado con el Premio Overton en 2019 por sus contribuciones a la biología computacional . [1] A partir de abril de 2022, será codirector ejecutivo del Instituto Suizo de Bioinformática SIB , junto con Ron Appel .

Educación

Dessimoz obtuvo su maestría en ciencias en 2003 [5] y su doctorado en ciencias de la computación en 2009 en la ETH Zurich en Suiza [9] , donde su investigación doctoral fue supervisada por Gaston Gonnet [3] y examinada por Amos Bairoch . [9]

Carrera e investigación

Después de una investigación postdoctoral en el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI) en el Wellcome Genome Campus en Hinxton , Cambridgeshire , [10] se unió al University College London (UCL) como profesor en 2013 y fue ascendido a Lector en 2015. [5] En 2015, se unió a la Universidad de Lausana como profesor, manteniendo un nombramiento en el UCL. [11] Desde 2016, Dessimoz se ha desempeñado como líder de grupo en el Instituto Suizo de Bioinformática [5] donde sus intereses de investigación son la bioinformática , la genómica , la filogenética , la evolución y la biología computacional . [2] [12] [13] [14] [15]

Dessimoz es conocido por su gestión de la Matriz Ortóloga (OMA) [4] que proporciona información sobre las proteínas ortólogas . OMA tiene aplicaciones importantes en la predicción de la función de las proteínas . [1] El enfoque de Dessimoz para la evaluación comparativa tuvo un gran impacto en tres subcampos clave de la biología computacional: la inferencia de ortología , la alineación de secuencias y la ontología genética (GO). [1] [16] [17]

Premios y honores

Dessimoz recibió el Premio Overton de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) en 2019 por sus destacadas contribuciones a la biología computacional. [1]

Referencias

  1. ^ abcde Kovats, Diane; Shamir, Ron; Fogg, Christiana (2019). "Premio Overton ISCB 2019: Christophe Dessimoz". F1000Research . 8 : 722. doi : 10.12688/f1000research.19220.1 . ISSN  2046-1402. PMC  6534074 . PMID  31164977.
  2. ^ abc Publicaciones de Christophe Dessimoz indexadas por Google Scholar
  3. ^ de Christophe Dessimoz en el Proyecto de Genealogía Matemática
  4. ^ ab Altenhoff, Adrian M; Glover, Natasha M; Train, Clément-Marie; Kaleb, Klara; Warwick Vesztrocy, Alex; Dylus, David; de Farias, Tarcisio M; Zile, Karina; Stevenson, Charles; Long, Jiao; Redestig, Henning; Gonnet, Gaston H; Dessimoz, Christophe (2018). "La base de datos de ortología OMA en 2018: recuperación de relaciones evolutivas entre todos los dominios de la vida a través de interfaces web y programáticas más ricas". Investigación de ácidos nucleicos . 46 (D1): D477–D485. doi :10.1093/nar/gkx1019. ISSN  0305-1048. PMC 5753216 . PMID  29106550. 
  5. ^ abcd Dessimoz, Christophe (2019). «Laboratorio Dessimoz». lab.dessimoz.org .
  6. ^ Publicaciones de Christophe Dessimoz de Europa PubMed Central
  7. ^ Publicaciones de Christophe Dessimoz indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  8. ^ Christophe Dessimoz en Twitter
  9. ^ ab Dessimoz, Christophe (2009). Genómica comparativa utilizando distancias evolutivas por pares. ethz.ch (tesis doctoral). ETH Zurich. doi :10.3929/ethz-a-005762050. hdl :20.500.11850/72801. OCLC  935351416. Icono de acceso abierto
  10. ^ Goldman, Nick; Bertone, Paul; Chen, Siyuan; Dessimoz, Christophe; LeProust, Emily M.; Sipos, Botond; Birney, Ewan (2013). "Hacia un almacenamiento de información práctico, de alta capacidad y bajo mantenimiento en ADN sintetizado". Nature . 494 (7435): 77–80. Bibcode :2013Natur.494...77G. doi :10.1038/nature11875. ISSN  0028-0836. PMC 3672958 . PMID  23354052. 
  11. ^ "Dr Christophe Dessimoz". ucl.ac.uk . Consultado el 6 de marzo de 2019 .
  12. ^ Wodak, Shoshana ; Sunnåker, Mikael; Busetto, Alberto Giovanni; Numminen, Elina; Corander, Jukka; Foll, Matthieu; Dessimoz, Christophe (2013). "Computación bayesiana aproximada". PLOS Computational Biology . 9 (1): e1002803. Bibcode :2013PLSCB...9E2803S. doi : 10.1371/journal.pcbi.1002803 . ISSN  1553-7358. PMC 3547661 . PMID  23341757. 
  13. ^ Anisimova, Maria; Gil, Manuel; Dufayard, Jean-François; Dessimoz, Christophe; Gascuel, Olivier (2011). "Estudio de métodos de soporte de ramificación demuestra precisión, potencia y robustez de esquemas de aproximación rápida basados ​​en verosimilitud". Biología sistemática . 60 (5): 685–699. doi :10.1093/sysbio/syr041. ISSN  1076-836X. PMC 3158332 . PMID  21540409. 
  14. ^ Eisen, Jonathan A. ; Altenhoff, Adrian M.; Dessimoz, Christophe (2009). "Proyectos y métodos de inferencia de evaluación filogenética y funcional de ortólogos". PLOS Computational Biology . 5 (1): e1000262. Bibcode :2009PLSCB...5E0262A. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000262 . ISSN  1553-7358. PMC 2612752 . PMID  19148271. 
  15. ^ Abbosh, Christopher; Birkbak, Nicolai J.; Wilson, Gareth A.; Jamal-Hanjani, Mariam; Constantin, Tudor; Salari, Raheleh; Le Quesne, John; Moore, David A.; Veeriah, Selvaraju; Rosenthal, Rachel; Marafioti, Teresa; et al. (2017). "El análisis filogenético del ctDNA describe la evolución del cáncer de pulmón en etapa temprana". Nature . 545 (7655): 446–451. Bibcode :2017Natur.545..446A. doi :10.1038/nature22364. ISSN  0028-0836. PMC 5812436 . PMID  28445469. 
  16. ^ Dessimoz, Christophe (2017). Dessimoz, Christophe; Škunca, Nives (eds.). Manual de ontología genética . Métodos en biología molecular. Vol. 1446. doi :10.1007/978-1-4939-3743-1. ISBN 9781493937431. ISSN  1064-3745. S2CID  3708801. Icono de acceso abierto
  17. ^ Gaudet, Pascale; Škunca, Nives; Hu, James C.; Dessimoz, Christophe (2017). "Manual sobre la ontología genética". Manual de ontología genética . Métodos en biología molecular. Vol. 1446. págs. 25–37. doi :10.1007/978-1-4939-3743-1_3. ISBN 978-1-4939-3741-7. ISSN  1064-3745. PMC  6377150. PMID  27812933 .