La Copa de la UEFA 1988-89 la ganó el Napoli sobre el Stuttgart .
Fue la cuarta temporada en la que los clubes ingleses fueron excluidos de las competiciones europeas. Los clubes de la liga inglesa que de otro modo se habrían clasificado fueron el Manchester United y el Luton Town .
Rumania cedió un lugar a Suecia. Los campeones alemanes obtuvieron una plaza para otra retirada albanesa.
Para la Copa de la UEFA 1988–89, a las federaciones se les asignan plazas según sus coeficientes de países de la UEFA de 1987 , que tienen en cuenta su desempeño en las competiciones europeas de 1982–83 a 1986–87.
Stuttgart ganó 3-2 en el global.
El Bayern de Múnich ganó 10-4 en el global.
2-2 en total. Groningen ganó por goles a domicilio.
El Lokomotive Leipzig ganó 7-0 en el global.
Heart of Midlothian ganó 4-0 en el global.
Austria Viena ganó 5-4 en el global.
El Sporting CP ganó 6-3 en el global.
4-4 en total. La Real Sociedad ganó por los goles a domicilio.
RFC Lieja ganó 11-1 en total.
Internazionale ganó 4-2 en el global.
Újpesti Dózsa ganó 2-1 en el global.
Los Rangers ganaron 5-2 en total.
El Dynamo Dresden ganó 2-0 en el global.
Burdeos ganó 3-2 en el global.
Dunajská Streda ganó 6-2 en el global.
1-1 en total. TPS ganó por goles a domicilio.
Waregem ganó 5-1 en total.
Malmö FF ganó 3-2 en el global.
2-2 en total. En primer lugar, Viena ganó gracias a los goles a domicilio.
La Juventus ganó 5-1 en el global.
RŠD Velež ganó 6-2 en el global.
El Athletic de Bilbao ganó 2-1 en el global.
El Benfica ganó 6-1 en el global.
Victoria București ganó 8-1 en el global.
Napoli ganó 2-1 en el global.
Partizan ganó 10-0 en el global.
Servette ganó 1-0 en el global.
El Dinamo Minsk ganó 2-1 en el global.
El Dinamo Zagreb ganó 2-1 en el global.
Colonia ganó 6-3 en el global.
Belenenses ganó 2-0 en el global.
La Roma ganó 4-3 en el global.
El partido fue interrumpido brevemente por la intervención de los bomberos debido a que los aficionados del Partizán iniciaron un gran incendio en la grada este del estadio al quemar la alfombra de esponja para salto de altura . Además, el capitán de la Roma, Giuseppe Giannini, recibió un golpe en la cabeza con una moneda lanzada desde las gradas mientras los aficionados del Partizán lanzaban misiles al campo tras uno de los goles de la Roma. Además de la multa monetaria de 200.000 francos suizos , la UEFA castigó al Partizan con la prohibición de asistir a un partido durante el partido de primera ronda de la Recopa de 1989-90 contra el Celtic . [3]
El Bayern de Múnich ganó 5-1 en el global.
Colonia ganó 3-1 en el global.
Stuttgart ganó 4-2 en el global.
4-4 en total. La Roma ganó por goles a domicilio.
0-0 en total. El RŠD Velež ganó 4-3 en los penaltis.
La Real Sociedad ganó 2-1 en el global.
Heart of Midlothian ganó 1-0 en el global.
Napoli ganó 3-1 en el global.
Burdeos ganó 2-0 en el global.
La Juventus ganó 7-4 en el global.
El Dynamo Dresden ganó 5-3 en el global.
2-2 en total. TPS ganó por goles a domicilio.
Internazionale ganó 2-1 en el global.
RFC Lieja ganó 3-2 en total.
Groningen ganó 3-1 en el global.
2-2 en total. Victoria București ganó por goles a domicilio.
3-3 en total. El Bayern de Múnich ganó por goles a domicilio.
La Real Sociedad ganó 3-2 en el global.
Stuttgart ganó 5-1 en el global.
Heart of Midlothian ganó 4-2 en el global.
Napoli ganó 1-0 en el global.
El Dynamo Dresden ganó 4-0 en el global.
La Juventus ganó 2-0 en el global.
3-3 en total. Victoria București ganó por goles a domicilio.
1-1 en total. Stuttgart ganó 4-2 en los penaltis.
El Bayern de Múnich ganó 2-1 en el global.
El Nápoles ganó 3-2 en el global.
El Dynamo Dresden ganó 5-1 en el global.
El Nápoles ganó 4-2 en el global.
Stuttgart ganó 2-1 en el global.
El Nápoles ganó 5-4 en el global.
