Citrobacter rodentium es unaespecie de bacteria gramnegativa descrita por primera vez en 1996. [1] Infecta el tracto intestinal de los roedores.
C. rodentium es un patógeno extracelular de roedores. [1] Si bien su estructura específica no se ha caracterizado en detalle, se pueden inferir varias características de esta especie a partir de su clasificación. Como miembro de la familia Enterobacteriaceae , es gramnegativa , tiene forma de bastón y no forma esporas.
C. rodentium contiene una isla de patogenicidad conservada en su genoma, el locus de borramiento de enterocitos (LEE). [2] El LEE codifica un sistema de secreción de tipo III que es fundamental para la infección y patogenicidad de C. rodentium . Solo se ha identificado un factor de virulencia específico de C. rodentium : cfc (factor de colonización de Citrobacter ). cfc codifica el pilus de CFC tipo IV , que tiene un papel desconocido, pero puede estar relacionado con múltiples aspectos de la patogenicidad. [2]
Un análisis del genoma de C. rodentium ha demostrado que la inserción del profago ha alterado varios de sus genes, incluidas las vías de biosíntesis de flagelos y el metabolismo del galactitol . [3]
Inicialmente considerado un biotipo patógeno de Citrobacter freundii , Citrobacter rodentium ha sido clasificado como una especie propia utilizando evidencia bioquímica y genómica. [1]
La secuenciación del genoma completo de la cepa ICC168 de Citrobacter rodentium reveló un solo cromosoma circular y cuatro plásmidos . [3] También reveló que C. rodentium comparte sintenia con Escherichia coli y otros miembros de Enterobacteriaceae . Además, el genoma contiene 17 islas genómicas , 10 regiones de profagos y 109 elementos de inserción . 4 Los análisis filogenéticos sugieren que Citrobacter es un género polifilético . [3]
La secuenciación adicional del genoma de la cepa EX-33 de C. rodentium mostró una similitud significativa con la cepa ICC168. [4]
C. rodentium ha perdido la capacidad de sintetizar flagelos debido a la inserción de profagos en genes que codifican elementos de la vía de biosíntesis. [4]
C. rodentium es un aerobio facultativo inmóvil que vive en el tracto intestinal de los ratones. La prueba de producción de indol es negativa y no puede crecer en citrato o KCN . Es negativo para la arginina dihidrolasa (lo que significa que no puede utilizar la arginina como fuente de carbono y energía) y es negativo para la producción de H 2 S. Además, no produce ácido a partir de sacarosa , docitol, melibiosa o glicerol. [1]
Por el contrario, C. rodentium dio positivo en la prueba de ornitina descarboxilasa , lo que indica que contiene la enzima ornitina descarboxilasa. También es positivo en la utilización de malonato . [1]
C. rodentium varía su metabolismo durante las diferentes fases de la infección. [5] La oxigenación del epitelio intestinal se produce como resultado de la infección por C. rodentium , lo que le permite pasar de la respiración anaeróbica a la respiración aeróbica. Esto ayuda a este patógeno a superar a muchos anaerobios obligados del microbioma del huésped. [5]
C. rodentium es un patógeno de ratones y causa lesiones de adhesión/borramiento en el epitelio intestinal. [1] Debido a su relación con E. coli , C. rodentium se utiliza como patógeno modelo para estudiar la infección por E. coli en ratones. [2] C. rodentium también posee intimina β, que es importante para su virulencia en ratones. [2]
El ciclo de infección de C. rodentium se ha estudiado en detalle y comprende cuatro fases principales: la fase de establecimiento (fase 1), la fase de expansión (fase 2), la fase de estado estable (fase 3) y la fase de eliminación (fase 4). [5] [6] [7] La respuesta inmunitaria también se ha estudiado en detalle y varía a lo largo de las fases de la infección. La activación del inflamasoma puede ser un aspecto importante de la infección por C. rodentium . [7]