El jugador juega como Chocobo, navegando por niveles generados aleatoriamente de misteriosas mazmorras para avanzar en la historia.
Hay varios personajes asociados, la mayoría de los cuales serán reconocibles para los veteranos de Final Fantasy, incluido Cid; una joven mago blanco, Shiroma; y Mog, un moogle.
[3] Al comienzo del juego, Chocobo sólo puede llevar unos pocos objetos en su inventario.
Chocobo y su compañero pueden atacar en cualquiera de ocho direcciones diferentes.
Chocobo también puede equipar varias garras como armas y sillas de montar como armaduras.
Por ejemplo, la señora Bomb deja que Chocobo se quede en su casa.
Algunos personajes se unen a Chocobo y pueden ser controlados por un segundo jugador o la IA.
También hay personajes que Chocobo puede convocar recogiendo plumas, como Titán, Sílfide, Ramuh y Bahamut.
Squaresoft anunció Chocobo's Dungeon 2 en julio de 1998, junto con planes para lanzar el juego en diciembre.
[8] La música fue compuesta por Kenji Ito y fue bien revisada por RPGFan, diciendo que la música era alegre, agradable y que no se podían "omitir" ninguna pista.
Chris Charla de NextGen se mostró generalmente positivo con el juego, a pesar de señalar que el juego no aporta nada nuevo al género.
[21] E. Coli de GamePro dijo que Chocobo's Dungeon 2 está dirigido principalmente a un público más joven debido a la ternura del juego, y también dice que los jugadores experimentados no encontrarán nada nuevo en él.