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Software para la mitigación de la pandemia de COVID-19

El software para mitigar la pandemia de COVID-19 adopta muchas formas. Incluye aplicaciones móviles para el rastreo de contactos y notificaciones sobre riesgos de infección, pasaportes de vacunación , software para facilitar (o mejorar) la eficacia de los confinamientos y el distanciamiento social , software web para la creación de servicios de información relacionados y software de investigación y desarrollo. Un problema común es que pocas aplicaciones interoperan, lo que reduce su eficacia.

Rastreo de contactos

Una aplicación de rastreo de contactos

Las aplicaciones de COVID-19 incluyen aplicaciones de software móvil para el rastreo de contactos digitales (es decir, el proceso de identificación de personas ("contactos") que pueden haber estado en contacto con un individuo infectado) implementadas durante la pandemia de COVID-19 .

Se han desarrollado o propuesto numerosas aplicaciones de rastreo, que cuentan con el apoyo oficial de los gobiernos en algunos territorios y jurisdicciones. Se han desarrollado varios marcos para crear aplicaciones de rastreo de contactos. Se han planteado inquietudes sobre la privacidad, especialmente en relación con los sistemas que se basan en el seguimiento de la ubicación geográfica de los usuarios de las aplicaciones.

Otras alternativas menos intrusivas incluyen la apropiación de señales Bluetooth para registrar la proximidad de un usuario a otros teléfonos celulares (la tecnología Bluetooth ya tiene experiencia en el rastreo de ubicaciones de teléfonos celulares). El 10 de abril de 2020, Google y Apple anunciaron conjuntamente que integrarían una funcionalidad para admitir dichas aplicaciones basadas en Bluetooth directamente en sus sistemas operativos Android e iOS . La aplicación de rastreo de COVID-19 de la India, Aarogya Setu, se convirtió en la aplicación de más rápido crecimiento del mundo, superando a Pokémon Go , con 50 millones de usuarios en los primeros 13 días de su lanzamiento. ( Artículo completo... )

Diseño

Las decisiones de diseño se relacionan con cuestiones como la privacidad, el almacenamiento de datos y la seguridad. Las aplicaciones por lo general no son interoperables. [1] [2]

Usar

El uso voluntario por parte del público fue ineficaz. [3] [4] [5] La falta de características y los errores redujeron aún más la utilidad. [6]

Algunas aplicaciones incluyen "check-ins" que permiten recibir notificaciones de exposición al ingresar a lugares públicos como gimnasios. [7] Un ejemplo de ello es el proyecto We-Care, que utilizó el anonimato y la información obtenida de fuentes colaborativas sobre qué check-ins son esenciales para alertar a los usuarios expuestos. [8] [9] [10]

Certificados de vacunación digitales

Los pasaportes de vacunación digitales y los certificados de vacunación utilizan software para verificar el estado de vacunación. [4]

Estos certificados se utilizaron para regular el acceso a eventos, edificios y servicios como aviones, salas de conciertos y clubes de salud [4] y los viajes a través de las fronteras. [11]

Obstáculos

Dada la distribución desigual de las vacunas en las distintas jurisdicciones, la concesión de privilegios basados ​​en la certificación del estado de vacunación significa que quienes tienen un acceso más fácil a las vacunas tienen un acceso injusto a esos privilegios. [12] Si el estado de vacunación solo se puede verificar mediante tecnología digital, quienes no tengan esa tecnología también pueden perder el acceso incluso si están vacunados. Estos mecanismos de privilegio pueden exacerbar la desigualdad, [13] aumentar los riesgos de infecciones o transmisión deliberadas, [11] [14] Las justificaciones de salud pública para restringir el comportamiento en función del estado de vacunación se han vuelto menos frecuentes en el transcurso de la pandemia, ya que las vacunas no detienen la transmisión.

Diseño

Algunos equipos están desarrollando soluciones interoperables, pero esto no es común. [4] [15] Los gobiernos expresan preocupaciones sobre la soberanía de los datos . [16]

La OMS creó un "grupo de trabajo centrado en establecer normas para una arquitectura común de certificado de vacunación inteligente digital que sirva de apoyo a las vacunas contra la COVID-19 y otras inmunizaciones". [13] [17]

La Iniciativa de Credenciales COVID-19 organizada por Linux Foundation Public Health (LFPH) es una iniciativa global que trabaja para desarrollar e implementar proyectos de certificación de credenciales que preserven la privacidad, sean a prueba de manipulaciones y verificables , basados ​​en el estándar abierto Credenciales Verificables (VC). [18] [19] [14]

Laurin Weissinger sostuvo que es importante que dicho software sea completamente libre y de código abierto , para aclarar conceptos y diseños, para que sea probado por expertos en seguridad y para describir los datos que se recopilan y cómo se utilizan para generar confianza. [20] Jenny Wanger sostuvo que es esencial que dicho software sea de código abierto. [21] Jay Stanley afirmó esta noción y advirtió que una "arquitectura que no es buena para la transparencia, la privacidad o el control del usuario" podría establecer un "mal estándar" para futuros sistemas de credenciales. [22]

Sitios web

Los paneles web [23] [24] se utilizan ampliamente para rastrear el estado de la pandemia. [ cita requerida ]

Scholia tiene un perfil para SARS-CoV-2 (Q82069695).

El proyecto Wikimedia Scholia proporciona una interfaz gráfica en torno a los datos de Wikidata (como la literatura sobre una proteína específica del coronavirus) para ayudar con la investigación, el análisis de la investigación, la interoperabilidad de los datos, las aplicaciones, las actualizaciones y la minería de datos. [25] [26]

Un grupo de archivistas en línea utilizó la biblioteca de acceso abierto basada en PHP y Linux Sci-Hub para crear un archivo de más de 5000 artículos sobre coronavirus . Hacer que el archivo sea de libre acceso actualmente es ilegal. [27] Sci-Hub proporciona acceso completo y gratuito a la mayoría de las publicaciones científicas sobre pandemias. [ cita requerida ]

Varios editores científicos crearon portales de acceso abierto, entre ellos Cambridge University Press , [28] la rama europea de la Scholarly Publishing and Academic Resources Coalition , [29] The Lancet , [30] John Wiley and Sons , [31] y Springer Nature . [32]

El médico y defensor del acceso abierto Josh Farkas ha añadido un capítulo sobre el tratamiento de la COVID-19 a su libro electrónico sobre medicina de cuidados intensivos , alojado por EMCrit . [33]

Software médico

Salud GNU

Pantalla principal del paciente de GNU Health en 2013

GNU Health , de código abierto, basado en Qt [34] [35] y GTK, ofrece una variedad de funciones predeterminadas para su uso durante pandemias [24] . Permite a las partes aunar esfuerzos en un único programa integrado, en lugar de programas individuales para fines específicos. Las funciones existentes incluyen una forma de hacer que la información clínica esté disponible y de actualizarla en cualquier institución de salud a través de un "ID universal de persona" único a nivel mundial. Incluye plantillas y funcionalidades de pruebas de laboratorio, firma digital y cifrado [36] .

Gestión de la vacunación

El software ayuda a gestionar la distribución de vacunas, incluida la verificación de la cadena de frío , y a registrar los eventos de vacunación. [37]

Cribado

En China, se han utilizado tecnologías web para orientar a las personas hacia los recursos adecuados. Se utilizan cámaras térmicas infrarrojas para detectar a las personas con fiebre. [38] Se ha utilizado el aprendizaje automático para el diagnóstico y la predicción de riesgos. [38]

Ponerse en cuarentena

Se ha utilizado el monitoreo electrónico para gestionar el cumplimiento de la cuarentena. Además, varios diseños de software pueden amenazar las libertades civiles y violar la privacidad. [38] China informa a las personas sobre si deben permanecer en cuarentena y durante cuánto tiempo a través de una aplicación de teléfono e informa a las autoridades sobre su cumplimiento. [39]

Datos genómicos

Gráfico de clados de mutaciones del SARS-CoV-2 en Nextstrain

Nextstrain es una plataforma de código abierto para datos genómicos de patógenos, como por ejemplo sobre la evolución viral , y se utilizó para investigar nuevas variantes .

Producción de vacunas

Se ha utilizado software en filtraciones y espionaje industrial de datos relacionados con las vacunas. [40] Se ha aplicado el aprendizaje automático para mejorar la productividad en la fabricación de vacunas. [41]

Modelado

Los modelos de software y simulaciones para el SARS-CoV-2, incluida la propagación, [42] los mecanismos y propiedades funcionales, [43] [44] [42] la eficacia de los tratamientos potenciales, [44] [42] los riesgos de transmisión , el modelado/seguimiento de la vacunación, ( dinámica de fluidos computacional , epidemiología computacional , biología computacional / biología de sistemas computacionales) fueron desarrollados por gobiernos, universidades y empresas.

También se utilizan software de modelado y software relacionado para evaluar los impactos sobre el medio ambiente y la economía .

Computación distribuida

El cliente plegable@home

El proyecto voluntario de computación distribuida Folding@home simula el plegamiento de proteínas . Se utilizó para la investigación médica. En marzo de 2020 se convirtió en el primer sistema del mundo en alcanzar un exaFLOPS [45] [46] [47] y alcanzó aproximadamente 2,43 x86 exaFLOPS el 13 de abril de 2020, muchas veces más rápido que Summit , la supercomputadora más rápida de ese momento. [48]

Ese mes, Rosetta@home se sumó a la iniciativa. Los investigadores anunciaron que Rosetta@home les había permitido "predecir con precisión la estructura a escala atómica de una importante proteína del coronavirus semanas antes de que pudiera medirse en el laboratorio". [49]

En mayo de 2020, se lanzó la alianza OpenPandemics—COVID-19 entre Scripps Research y World Community Grid de IBM . La alianza es un proyecto de computación distribuida que “ejecutará automáticamente un experimento simulado en segundo plano [de computadoras domésticas conectadas] que ayudará a predecir la eficacia de un compuesto químico particular como posible tratamiento para la COVID-19 ”. [50]

Investigación sobre reutilización de fármacos y desarrollo de fármacos

Se han utilizado supercomputadoras, incluidas Summit y Fugaku , para explorar posibles tratamientos ejecutando simulaciones con datos sobre medicamentos ya aprobados. [51] [52] [53] [42] [44] Dos ejemplos tempranos de consorcios de supercomputadoras son:

Véase también

Referencias

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Enlaces externos