Helen Miriam Berman es profesora titular de Química y Biología Química en la Universidad Rutgers y exdirectora del Banco de Datos de Proteínas de la RCSB (una de las organizaciones miembro del Banco Mundial de Datos de Proteínas ). Bióloga estructural, su trabajo incluye el análisis estructural de complejos proteína-ácido nucleico y el papel del agua en las interacciones moleculares. También es la fundadora y directora de la Base de Datos de Ácidos Nucleicos y dirigió la base de conocimientos de genómica estructural de la Iniciativa de Estructura de Proteínas. [1] [2] [3]
Berman nació en Chicago, Illinois, y creció en Brooklyn, Nueva York. Su padre, David Bernstein, era médico y su madre, Dorothy Bernstein (de soltera Skupsky), dirigía el consultorio de su padre. Inspirada por su padre, un hombre muy trabajador y estudioso, se interesó por la ciencia desde niña y planeó convertirse en científica o médica. Su madre, que estaba muy involucrada en la comunidad y en el trabajo voluntario, la influyó para que participara en actividades comunitarias durante toda su vida.
Durante la secundaria, Berman trabajó en el laboratorio de Ingrith Deyrup en Barnard College . Deyrup animó a Berman a asistir a Barnard como estudiante de grado. Mientras estaba en la universidad, trabajó en un laboratorio de la Facultad de Médicos y Cirujanos de la Universidad de Columbia con Barbara Low . Allí, Berman aprendió sobre cristalografía , que se convertiría en su pasión de toda la vida. Se graduó de Barnard con una licenciatura en química en 1964.
Después de la universidad, Berman asistió a la Universidad de Pittsburgh para realizar estudios de posgrado, lugar que eligió porque era el único lugar del país con un departamento de cristalografía y uno de los pocos donde se impartía la materia de cristalografía. Allí trabajó con George A. Jeffrey en la estructura de los carbohidratos y recibió su doctorado en 1967. Berman permaneció en la Universidad de Pittsburgh durante dos años más como investigadora postdoctoral .
En 1969, Berman se trasladó al Centro Oncológico Fox Chase de Filadelfia, donde trabajó en el laboratorio de Jenny P. Glusker antes de iniciar su propio programa de investigación independiente como miembro de la facultad en 1973. En Fox Chase, Berman se interesó en las estructuras de los ácidos nucleicos y en la bioinformática. Sabía que la organización lógica de los datos los haría útiles para una variedad de científicos.
En junio de 1971, Berman asistió a un simposio en el Laboratorio Cold Spring Harbor , donde varios científicos acordaron que los datos sobre el creciente número de estructuras de proteínas deberían archivarse en una base de datos. [4] Esa reunión condujo a la creación del Banco de Datos de Proteínas (PDB) en el Laboratorio Nacional de Brookhaven . [5] [6]
En 1989, Berman se trasladó a Rutgers y en 1992, junto con otros científicos, cofundó la Base de Datos de Ácidos Nucleicos (NDB) para recopilar y difundir información sobre la estructura de los ácidos nucleicos. [7] En Rutgers, continuó estudiando los ácidos nucleicos, sus interacciones con las proteínas, [8] y también investigó la estructura del colágeno en colaboración con Barbara Brodsky y Jordi Bella. [9] Aparece como depositante de 38 estructuras en el PDB desde 1992 hasta 2011, de complejos de proteínas/ácidos nucleicos y sus componentes (por ejemplo, 1RUN, 3SSX, 2B1B), fragmentos de colágeno (por ejemplo, 1CGD, 1EI8) y otras macromoléculas.
En 1998, Berman y Philip Bourne compitieron juntos por el contrato para el Protein Data Bank y ganaron, y la base de datos se trasladó de Brookhaven a los auspicios del Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), actualmente una colaboración entre Rutgers y la Universidad de California, San Diego. Junto con sus colegas, Berman rediseñó el sistema de gestión de datos, añadió nuevas herramientas de usuario e hizo que la base de datos fuera consultable. [10] Desde 2003, el archivo PDB ha sido gestionado por el Protein Data Bank mundial (wwPDB), una asociación fundada por Berman que consta de organizaciones que actúan como centros de deposición, procesamiento de datos y distribución de datos PDB: el RCSB, el PDBe en Europa y el PDBj en Japón. [11] En 2006, el banco de datos BioMagResData (BMRB) para estructuras de resonancia magnética nuclear (RMN) [12] se convirtió en el cuarto miembro del wwPDB. [13] A julio de 2018, el NDB contiene más de 9600 estructuras de ácidos nucleicos y el PDB contiene más de 142 000 estructuras macromoleculares.
También liderada por el RCSB, la base de conocimiento de genómica estructural de la Iniciativa de Estructura de Proteínas (PSI) se lanzó en la primavera de 2008 para proporcionar un portal actualizado continuamente para datos de investigación y otros recursos de las iniciativas de la PSI. [14]
Berman también ha participado activamente en la comunidad científica, donde fue presidenta de la Asociación Cristalográfica Estadounidense en 1988, asesora tanto a los Institutos Nacionales de Salud como a la Fundación Nacional de Ciencias y forma parte del consejo editorial de varias revistas. Su trabajo ha sido publicado ampliamente en revistas científicas revisadas por pares . [8] [9] [15] [16] [17]
Berman fue el productor ejecutivo y creador de la serie documental Target Zero, que se centra en los aspectos médicos y sociales del tratamiento y la prevención del VIH. [18] Los tres cortometrajes entrelazan historias de pacientes reales, entrevistas con médicos, proveedores médicos y científicos destacados, y animaciones moleculares de última generación. Estos relatos arrojan luz sobre la compleja historia del control de la epidemia del VIH y revelan la necesidad constante de una atención compasiva y centrada en el paciente y una verdadera comprensión a nivel celular de la ciencia que sustenta los tratamientos. [19]
Berman se ha casado dos veces: con el ingeniero Victor Berman en la década de 1960, y con el biólogo molecular Peter Young entre 1976 y 1999. De su segundo matrimonio tiene un hijo, Jason Asher Young (nacido en 1979), físico.
Durante la década de 1980, a Berman le diagnosticaron cáncer de mama. La experiencia la hizo centrarse más en su vida y su carrera y la hizo interesarse en apoyar a otras mujeres que enfrentan el mismo diagnóstico.