Según la constitución de 2002, es gobernado por un presidente electo, así como en las otras islas, con el gobierno federal que ha reducido mucho su poder.
Esto le valió el reconocimiento del país que le premió condecorándole con la medalla de la media luna verde al mérito y los servicios prestados (nombrándole caballero de dicha orden), pasando ésta a ser su segunda condecoración, pues ya había obtenido años atrás la medalla al trabajo del Gobierno de Camerún.
Por varios siglos, Gran Comora estuvo dividido en más de una docena de sultanatos, incluyendo Bambao, Itsandra, Mitsamihuli, Bajini, Hambu, Washili, Hamahame, Mbude, Hamvu y La Dombe.
Ese mismo año, Francia estableció un protectorado sobre la isla y en 1893 Saidi Ali fue enviado al exilio.
Gran Comora se convirtió en la única isla bajo control federal.