Fue fundada por comerciantes de Kuwait a mediados del siglo XVIII, destruida en 1811 y abandonada en 1900.

[1]​ Con una superficie cercana a 4,6 km², Zubarah es el sitio arqueológico más importante del país, que comprende la ciudad fortificada, un puerto, un canal al mar, dos murallas, el fuerte Murair y el más reciente, el fuerte Zubara.

En 1944, los británicos negociaron un arreglo acordando en Baréin los derechos de aduana y pasto, pero la tensión subsistió.

Shaykh Ali Al Thani respondió reocupando el fuerte y en 1956 aumentó los efectivos de policía.

Baréin protestó y en 1992 propuso llevar conjuntamente a la Corte todos los conflictos territoriales incluyendo el de Zubarah, pero Catar lo rechazó.