Entidades conocidas como etéreos viajaron al mundo humano desde portales llamados Cavidades, causando estragos y aniquilando a la mayoría de la población.

[5]​ Al igual que en los juegos anteriores de HoYoverse, cuenta con una habilidad defiitiva la cual puede ser usada cuando su respectiva barra esté completa.

[7]​[8]​ A medida que avanzan, el Proxy reclutará nuevos miembros para su grupo mientras continúan luchando contra los etéreos y otros enemigos.

Mientras explora Nueva Eridu, el jugador puede encontrar ubicaciones como Waterfall Soup y Coff Cafe, que permiten la compra de consumibles especiales, proporcionando bonificaciones limitadas a las estadísticas del agente o la carga de batería moneda del juego Denny.

Estos crecen exponencialmente de la nada, creando dimensiones desordenadas donde vagan misteriosos monstruos apodados los “etéreos”.

Anby Demara y Billy Kid, dos agentes del grupo de recursos humanos “Gentle House” (también conocido como “Liebres Astutas”) caen en una Cavidad durante una misión para recuperar una caja fuerte robada del Instituto Cavidad por una banda local de matones.

Su líder, Nicole Demara, se pone en contacto con Phaethon para localizar a los dos agentes y escoltarlos fuera de la Cavidad, aunque la caja fuerte se pierde en el proceso debido a un ataque de un poderoso etéreo.

Mientras están inconscientes, una entidad los obliga a aceptar un "contrato" con ella; después de despertar, se revela que la entidad es una poderosa Inteligencia Artificial llamada “Fairy”, que se ha instalado en el disco duro de Phaethon.

Según Nekomata, Nicole aceptó un trabajo de ella para recuperar una "reliquia familiar" de la banda Colmillo Rojo, la misma banda que inicialmente había robado la caja fuerte que contenía a Fairy del Instituto Cavidad.

Aunque Sarah escapa, Perlman es arrestado y Vision Corporation se ve envuelta en un escándalo masivo.

Posteriormente, se revela que la comisión de Nekomata para recuperar su "reliquia" fue una invención; una vez había sido criada por Miguel Silver, el líder de la banda Colmillo Rojo quien las Liebres Astutas se habían visto obligadas a matar en defensa propia después de que se corrompiera en un Etéreo durante su misión para recuperar la caja fuerte.

Nicole también revela que Miguel fue contactado por una "parte desconocida" para robar la caja fuerte en primer lugar.

Reciben una llamada de socorro de Billy, quien informa al Proxy que se ha liberado gas somnífero en la aeronave, noqueando a todos y que alguien está controlando remotamente la aeronave para dirigirla hacia los Ballet Twins.

Sin embargo, durante la carrera, Lucius usa explosivos para retrasar a Calydon, lo que les permite llegar primero al lago Cinderglow.

Después de presentar sus respetos, se revelan como los estudiantes e hijos adoptivos de “Carole Arna”, una ex profesora del Instituto Cavidad a quien se culpó por el incidente que destruyó la antigua ciudad y formó “Cavidad Cero”.

Las Liebres Astutas intervienen, forzando un enfrentamiento que se rompe cuando un tercer desconocido ataca al grupo.

[14]​ Es una tienda de videos en Nueva Eridu donde Belle y Wise alquilan cintas VHS mientras viven en el segundo piso sobre su negocio.

Anteriormente conocida como Gentle House, es una agencia de trabajo temporal a pequeña escala que acepta diversos encargos para clientes que no pueden o no quieren contratar a una agencia más grande (o con mayor reputación).

Anby intenta mejorar sus habilidades sociales imitando escenas de películas populares, pero con poco éxito.

Un superfan de Starlight Knights que se refiere a sus revólveres personalizados como sus "chicas".

A pesar de su imponente presencia, Ben rara vez se enoja fuera del combate.

Una sirvienta tímida y ansiosa que maneja una sierra circular muy grande como su herramienta principal.

Una tiburón antropomórfico Thiren que prefiere pasar el rato con sus amigos en lugar de trabajar o participar en actividades del club.

Un lobo blanco antropomórfico Thiren, que actúa como mayordomo principal y utiliza un estilo de lucha basado en patadas para despachar enemigos con sus piernas cibernéticas.

Aunque es la líder de los Sons of Calydon, Lucy afirma que es tan "simple" como una ensalada César.

Prefiere descansar cuando no está trabajando activamente y maneja un hacha de gran tamaño.

Más tarde se revela que es una espía infiltrada por una empresa rival con el nombre en clave "Scheele's Green".

[24]​ Según el productor Li Zhenyu, los protagonistas principales Wise y Belle tienen papeles independientes entre sí.

[25]​ HoYoverse reveló el juego en mayo de 2022 y comenzó a realizar pruebas beta cerradas, para PC e iOS en agosto del mismo año.

[36]​[37]​[38]​ Antes del lanzamiento del juego, el sitio web chino de noticias sobre videojuegos 17173 señaló que HoYoverse tenía una experiencia significativa con los juegos de acción, y consideró que Zenless Zone Zero era tanto un regreso al género como un posible avance para la empresa.