Nakata es principalmente conocido por CAPSULE, su grupo junto con la vocalista Toshiko Koshijima, y también por sus trabajos con Perfume, MEG, Ami Suzuki y Kyary Pamyu Pamyu.
Desde el 2003 tuvo su propio sello discográfico, contemode, como subsello de Yamaha Music Communications aunque actualmente no se encuentra en uso.
En 1996 Nakata envió dos canciones en formato Midi compuestas por él mismo a un concurso musical de Yamaha, donde ganó uno de los premios a la mejor técnica.
El 2007 colaboró por primera vez con Ami Suzuki para "FREE FREE/SUPER MUSIC MAKER", y este sencillo se convirtió en el más exitoso del proyecto "join" de la cantante, y n.º 1 en varias listas de música electrónica.
Además, en enero del 2017, Yasutaka tiene una colaboración con Kyary y con la cantante y compositora inglesa, Charlotte Emma Aitchison, conocida profesionalmente como Charli XCX, en la canción "Crazy Crazy".