Usualmente se lleva a cabo en Burlingame, California, durante el otoño.
En la convención se realizan eventos en donde voluntarios conocidos como "bishōnen", representan a personajes populares que se muestran en cualquier medio de comunicación yaoi, y la mayoría también organizan los mismos eventos.
Un tuit en enero de 2019 indicó que una nueva organización sin fines de lucro podría hacerse cargo del evento, pero esto nunca se materializó.
A medida que el género se expande en los Estados Unidos, las empresas que asisten a Yaoi-Con se han interesado en traer huéspedes con ellos.
Debido a la naturaleza adulta de su temática, Yaoi-Con requiere que todos los asistentes tengan al menos 18 años de edad y se pide la identificación al registrarse.