Yamith Cuesta comenzó jugando con el club bogotano Santa Fe en el año 2007.
Para el 2008 es adquirido por el club Expreso Rojo de la Primera B, club al cual perteneció hasta el mes de agosto del 2009.
Es confirmado como nuevo jugador del Chivas USA en la Major League Soccer de los Estados Unidos.
[1] Luego de jugar dos temporadas con el equipo californiano, es adquirido por el Chicago Fire en 2011.
[3] Para el año 2016, Cuesta vuelve al equipo en el que se formó,y tras 9 años vuelve al equipo de la capital de Colombia.