El Yamato fue el único buque de su clase en ser construido en Kobe, ya que los otros dos, Katsuragi y Musashi lo fueron en Yokosuka.

Su diseño contaba con proa recta, y una nueva disposición de los cañones principales, que permitían su empleo tanto hacia proa como por las bandas.

En 1907 su armamento fue nuevamente modificado, al tiempo que su clasificación cambiaba, pasando a ser retirado como unidad militar y convertido en buque de investigación hidrográfica.

En 1935 cesó en esa labor y fue finalmente retirado del listado naval.

Resultó hundido durante un tifón en 1945, siendo reflotado y desguazado 5 años después.