Yabebyry fue fundado en el año 1790, siendo Gobernador del Paraguay Joaquín Alós y Brú.

La región es más bien una llanura, en donde se extienden extensas praderas, sin embargo emergen algunos cerros en la zona.

Todo el Departamento de Misiones corresponde a la ecorregión denominada Ñeembucú, que comprende grandes zonas inundables.

Cuenta con un área protegida que es el Refugio de Vida Silvestre Yabebyury, declarada como tal en el año 1993.

Su población es mayoritariamente rural, con una ligera predominancia de hombres, ocupada en actividades agropecuarias.