[1]​ Nació en East Kilbride, hermano mayor del cirujano John Hunter.

Después de estudiar teología en la Universidad de Glasgow, comenzó a estudiar medicina en 1737 y estudió bajo la tutela de William Cullen.

Recibió formación en anatomía en el Hospital de St.

George en Londres y se especializó en obstetricia.

En 1764, se le nombra médico de la Reina Carlota de Mecklemburgo-Strelitz.