Wilhelm Lilljeborg (* 6 de octubre de 1816 - 24 de julio de 1908) fue un zoólogo sueco; profesor de Zoología en Upsala, llegando a ser rector de 1864 a 1865.

Se lo conoce particularmente por sus trabajos sobre Cladocera de Suecia, y Balaenoptera en 1861 identificando subfósiles.

Fue de los primeros zoólogos de aceptar la importancia en la cadena alimentaria de Cladocera.

La abreviatura Lilljeborg se emplea para indicar a Wilhelm Lilljeborg como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.