Luego asistió a las universidades de Friburgo y Múnich.
En 1939, concluyó sus estudios médicos y se convirtió en médico de las SS. Hoven ascendió al rango de Hauptsturmführer (Capitán) en las Waffen-SS.[2] Hoven participó en la administración de experimentos médicos sobre el tifus y la tolerancia del suero que contiene fenol, y que condujo a la muerte de muchos reclusos.
También participó en programas de eutanasia alemanes, durante los cuales las personas con discapacidad fueron asesinadas, junto con personas judías que no se consideraban aptas para trabajar.
[3] Fue arrestado por los nacionalsocialistas en 1943, acusado de dar una inyección letal de fenol a un oficial de las SS que fue testigo potencial en una investigación contra Ilse Koch, con quien se rumoreaba que Hoven estaba teniendo una aventura.
[4] Fue declarado culpable y condenado a muerte, aunque fue puesto en libertad en marzo de 1945 debido a la escasez de médicos.