[3]​ El embarque se desarrolló sin novedades y el avión se dirigió a pista de despegue donde efectuó el despegue a las 14:26 hora local (6:26 UTC).

El vuelo se desarrolló sin incidentes, y a una altitud de 37.000 pies sobre el nivel del mar.

[4]​ A las 15:23 hora local (8:23 UTC), el avión de la compañía indonesia comenzó el descenso hacia su destino del aeropuerto de Yakarta.

Las maniobras de aproximación al aeropuerto se desarrollaron con unas fuertes precipitaciones, que limitaron la visibilidad en el momento del aterrizaje a unos 1000 pies (430 metros), con vientos de 15 nudos(27 km/h) y ráfagas de 30 nudos(55 km/h).

[5]​ El MD-90 de Lion Airlines, fue autorizado a aterrizar a las 15:41 hora local (8:41 UTC) en la pista 25L, tomando tierra a las 15:43 (8:43 UTC)[5]​ Tras el aterrizaje, el avión se escoró hacia la izquierda, se salió de pista y, tras tocar con la cola en el campo, se golpeó el tren de aterrizaje y rompió el ala izquierda.