[3]​[4]​ El vuelo 791 se operó con un carguero ATR 72, El capitán y el primer oficial eran los únicos ocupantes de la aeronave.

El vuelo 791 partió de Taoyuan a la 1:04 a. m. hora local (17:04 UTC), A la 1:51 a. m., el copiloto solicitó permiso al control de tráfico aéreo, para descender del nivel de vuelo 18 000 pies a 16 000 pies, El controlador aprobó la solicitud y el primer oficial reconoció.

Según su instructor, el capitán repitió el entrenamiento y sus resultados mejoraron.

A pesar de esto, el instructor dijo que el capitán estaba "todavía inestable".

No se informaron problemas durante el entrenamiento del primer oficial.

Los Investigadores escuchan la CVR, y se sorprenden al descubrir que los pilotos reaccionaron demasiado tarde al problema del Congelamiento: "Alarma de Congelamiento" Capitán: Es un trozo bastante grande de hielo Capitán: Vaya, es un trozo enorme Copiloto: ¿Qué hielo?

Capitán: ¿No te parece que hay demasiado hielo en las alas?

"La aeronave impacta bruscamente el océano" La CVR registró una gran cantidad de conversaciones no pertinentes.

Luego, el capitán explicó cómo se acumulaba el hielo en el avión a las 1:44.

Se escuchó entonces una breve conversación no pertinente, tras la cual sonaron varias alarmas hasta el final de la grabación.

El FDR indicó que el piloto automático se desactivó en el momento del impacto.