Villa de San Francisco es un municipio del departamento de Francisco Morazán en la República de Honduras.

Su nombre es en honor a Francisco de Asis, santo de la iglesia católica.

El municipio, situado a unos 68 km de Tegucigalpa.

[3]​ Su economía se basa en la agricultura y ganadería, siendo los principales cultivos: caña de azúcar, maíz, frijol, sandía y plátano.

Las principales fuentes de trabajo son una "Central Azucarera" y "sandillera y melonera SOL" donde sus habitantes en el tiempo de la zafra y cultivo, cosecha de sandía obtienen empleos temporales.