Synchytrium endobioticum es un hongo del grupo de los quitidriomicetos perteneciente a la familia Synchytriaceae.
En la taxonomía antigua, S. endobioticum se consideraba perteneciente al subgénero Mesochytrium, aunque se ha sugerido que debería trasladarse al subgénero Microsynchytrium debido a su forma de germinación.
Como otros hongos quitridios, S. endobioticum no desarrolla micelio.
Dichas esporas de resistencia germinan y producen de una a muchas zoosporas cuando las condiciones son benignas, y dichas zoosporas infectan a las células vegetales, produciendo un talo, o a veces un zoosporangio, que ya ocasionan la infección.
Se requiere una alta humedad ambiental para que la infección prospere.