Originalmente se aisló de la orina humana, pero se sabe que está presente en diversas ubicaciones fisiológicas, tales como el plasma sanguíneo y la matriz extracelular.

Su sustrato principal es el plasminógeno, el cual es un zimógeno inactivo de la serín proteasa plasmina.

Ello hace que la uroquinasa se indique en ciertos tipos de cáncer y enfermedades vasculares.

La uroquinasa se sintetiza como un zimógeno y es activado por la ruptura proteolítica entre la posición L158 and I159.

Las dos cadenas resultantes se mantienen unidas por puentes de disulfuro.