En 1640, cuando Finlandia formaba parte de Suecia, la reina Cristina hizo fundar en Turku la tercera universidad del reino, es decir, la Academia de Turku.
Además, ocupa un lugar privilegiado el medio ambiente, en especial el archipiélago de Turku, que forma un conjunto único paisajístico y un hábitat ecológico especial en el área del Mar Báltico.
Desde hace varios años, la Universidad de Turku promueve sistemáticamente la colaboración en el ámbito del Mar Báltico, especialmente con las universidades de Estonia, Letonia, Lituania, Polonia, Alemania y Rusia (San Petersburgo y Kaliningrado), mientras que la colaboración con varias universidades de Suecia, Noruega y Dinamarca, ya tiene más arraigo.
La universidad ha establecido la colaboración en el área del Báltico como uno de sus enfoques principales en cuanto a las relaciones de desarrollo exteriores encaminadas a estrechar los lazos entre el mundo académico y la sociedad en general.
Además de la colaboración internacional con los países vecinos, la Universidad de Turku participa en varios proyectos a nivel europeo, Desde 1995, la universidad es miembro del Grupo Coimbra, que agrupa a 37 universidades europeas, y participa en numerosos proyectos que incluyen, entre otros, un programa de becas para profesores e investigadores jóvenes de universidades latinoamericanas (Scholarships Programme for Young Professors and Researcher from Latin American Universities).