Fue fundada en 1827 por Francisco de Paula Santander y Simón Bolívar, lo que la constituye en la universidad pública más antigua del Caribe colombiano.

Y actualmente, es la primera universidad pública de Colombia en recibir la acreditación internacional.

En el 2023 se encuentra en el puesto 19 entre las universidades colombianas que fueron evaluadas en el ranking de QS para América Latina y el Caribe.

La UdeC tiene programas en ciertos municipios del departamento de Bolívar y Córdoba.

En el año 2017, la Institución dio sus pasos hacia la acreditación internacional, recibiendo la primera acreditación internacional de programa académico, otorgada al programa de Enfermería bajo el sistema ARCU-SUR, mecanismo de acreditación regional del MERCOSUR[8]​.