En el año 2024 cuenta con unos 9100 alumnos, repartidos en tres campus (Vena, San Amaro - Milanera y Miranda de Ebro).En un primer momento es regida por una comisión gestora, presidida por el catedrático de Valladolid Marcos Sacristán Represa hasta 1997.Su primer rector fue catedrático de Química-Física José María Leal Villalba, desde 1997 al 2008.Más adelante, se restauró la Puerta de los Romeros, sacando a la luz todo su esplendor.En el Hospital del Rey se encuentran el Rectorado y la Facultad de Derecho.También hay un segundo texto de salutación, sin firma: Cada doctor está representado en el jardín por un árbol (se plantaron acebos, cedros, pinos, serbales, fresnos, robles, tejos y encinas, cada uno identificado y asignado a una personalidad diferente).
Rectorado de la UBU.
Biblioteca General.
Hospital de la Concepción.
Complejo residencial Miguel Delibes (Sedano).
Facultad de Educación.
Escuela Politécnica Superior, Edif. La Milanera.
Facultad de Ciencias.
Facultad de Ciencias Económicas y Empresariales.
Residencia Universitaria
Camino de Santiago
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Las dependencias del antiguo Hospital Militar de Burgos acogen las Facultades de Ciencias de la Salud y de Humanidades y Comunicación.
Centro I+D+i y Centro de Investigación de Biotecnología Alimentaria (CIBA).