Bajo esa denominación quedan comprendidas las tres universidades que se crearon a partir de aquella, y que gracias a su proximidad trabajan de manera estrecha.
Sus facultades e institutos sobrevivieron como instituciones independientes y gracias a la ley Loi Faure, se unieron de nuevo todas las instalaciones en 1968, tras una reforma educativa aprobada por el gobierno francés, para en los años sucesivos, y hasta 1973, dar lugar a tres universidades.
La facultad de medicina se alojó durante mucho tiempo en el Palais du Pharo.
En 1969 se fundaron dos nuevas universidades y en 1973 la tercera, de forma que son 3 las universidades que llevan el nombre Aix-Marseille.
Desde 2004 las 3 universidades han reforzado sus lazos para ofrecer a sus 70.000 estudiantes totales una estrategia común así como sinergias para desarrollar su oferta académica.