Tiempo más tarde las instalaciones son reubicadas en el edificio otorgado por la Cooperativa de Ejidatarios y Obreros del Ingenio Mante, S.C.L.
Sin embargo, se presentan una serie de problemas que amenazan con destruir este esfuerzo.
[1] A principios del año 2000 se actualizan y reestructuran los planes educativos que se ofertan en el Campus, el Modelo Curricular Tradicional cambia al Modelo Curricular Flexible MISIÓN XXI, cambian sus nombres las carreras de: Licenciado en Contaduría e Informática a Contador Público y la de: Ingeniero en Alimentos a Ingeniero Bioquímico Industrial.
Para el 2005 se pone en marcha el modelo Curricular Flexible MILLENIUM III, donde se actualizan nuevamente los planes y programas de estudio de la oferta académica en la Universidad, respetando los acuerdos de la SEP.
La Unidad Académica Multidisciplinaria Mante cuenta con las siguientes carreras: