El club, se afilia a la Liga Peruana de Fútbol, en la División Intermedia.
Luego se afilia a la División Intermedia en 1916, organizada por la Liga Peruana de Foot Ball.
Cabe recalcar, que el club fue goleado[2] repetidamente por el Sport Alianza.
El club Unión Perú se mantuvo participando en la División Intermedia, hasta 1929.
Sin embargo, pocos años después, regresa a participar y se mantuvo hasta 1940.