La perturbación desarrolló bandas de lluvia y gradualmente se organizó mejor.

[1]​[3]​ Giró hacia el oeste el 4 de diciembre, debido a una cresta al norte.

[1]​[3]​ Mientras continuaba generalmente hacia el oeste, el ojo de Pongsona gradualmente se fue organizando mejor.

Como resultado, muchos ciudadanos sintieron que no estaban preparados e insuficientemente advertidos sobre el tifón.

[7]​ Se abrieron nueve refugios en las Islas Marianas del Norte para alojar a las familias que necesitan ayuda.

Gutiérrez tomó medidas similares para declarar el estado de emergencia en la zona.

[11]​ Al principio de su duración, Pongsona afectó por primera vez a Pohnpei como una tormenta tropical.

Allí, produjo fuertes lluvias y ráfagas de viento, aunque se reportaron pocos daños.

Más tarde, trajo vientos con fuerza de tormenta tropical a Chuuk.

Muchos anemómetros cerca de la costa norte fallaron debido a los vientos.

[7]​ Los vientos derrumbaron varias paredes en el Guam Memorial Hospital, lo que provocó daños importantes en las dos terceras partes del norte de la instalación y el cierre de varias unidades.

Se produjeron inundaciones considerables por marejada ciclónica desde Tumon hacia el sur hasta Piti, dejando algunos edificios en la costa oeste de la isla inundados con 1 m (4 pies) de agua.

Como seis tifones habían pasado directamente sobre la isla durante los diez años anteriores, los funcionarios de Guam promulgaron estrictas normas de construcción, reduciendo al mínimo las muertes y lesiones.

La combinación de vientos y otros efectos del tifón destruyó 114 casas, dañó severamente 154 y causó daños menores a 306; en la isla, unas 200 familias se quedaron sin hogar.

Además, el tifón causó graves daños a los cultivos de la isla.

Los vientos dañaron las líneas eléctricas y provocaron dos cortes de energía en toda la isla.

[10]​ En Saipán, dos casas fueron destruidas y quince resultaron dañadas, siete de forma severa.

[10]​ El mismo día que el tifón Pongsona azotó Guam, el presidente George W. Bush declaró la isla como una zona de gran desastre.

[16]​ Inmediatamente después del tifón, FEMA asignó varias agencias federales para responder a la isla de Rota.

La Administración de Pequeñas Empresas de los Estados Unidos aprobó 147 préstamos a bajo interés por $9.1 millones (2003 USD, $ 12.8 millones 2021 USD) para individuos y empresas y para daños económicos en Rota.