A pesar de sus orígenes humildes, se cree que ingresó al Trinity College de Cambridge en 1569 y se graduó como bachiller universitario en letras en 1574.
Phelippes era un lingüista que hablaba francés, italiano, español, [6] latín y alemán.
Según el historiador Neville Williams, [8] las cartas eran pasadas de contrabando a María Estuardo a través de barriles vacíos desde una cervecería en Burton upon Trent que abastecía la casa en Chartley Manor donde estaba prisionera bajo la custodia de Sir Amias Paulet.
En septiembre de 1586, Pasquier confesó haber escrito cartas cifradas para María.
[9] Pasquier recordó una carta dirigida al embajador francés Michel de Castelnau, [10] pidiéndole que negociara un perdón para Francis Throckmorton, que fue ejecutado en 1584 por su participación en la trama homónima.