Thomas Bauer (Viena, 24 de enero de 1986[1]) es un portero profesional de balonmano[2] nacido en Austria, que juega en el JAGS Vöslau.
Antes de esto, lo hizo durante el lapso de seis años en Aon Fivers Margareten en la capital austríaca, Viena, luego militó por dos años en la TV Korschenbroich, y un año por HSG FrankfurtRheinMain.
Para la temporada 2013/14 Thomas Bauer dejó su club y firmó para el TBV Lemgo.
En la temporada 2015/16 fue el club francés Istres Ouest Provence quien se hizo de sus servicios.
Está casado con Laura Bauer, una jugadora de balonmano austriaca.