Sin embargo, la mayoría de los personajes son originales del juego, que se centra en un profesor universitario Lee Everett, quién rescata y después toma cuidado de la pequeña Clementine.
The Walking Dead ha sido aclamado por la crítica, con las críticas que elogian el duro tono emocional de la historia y la enfática conexión que se establece entre Lee y Clementine.
La historia se ve afectada tanto por las opciones de diálogo del jugador y sus acciones durante los eventos de tiempo rápido, que a menudo puede dar lugar, por ejemplo, a que ciertos personajes mueran, o a un cambio adverso en la resolución de un determinado personaje o personajes hacia Lee.
Las opciones también fueron rastreadas por Telltale, y se utilizan para influir en el guion de episodios posteriores.
Allí se refugian en una droguería junto a otros sobrevivientes: Glenn, Carley, Doug, Lilly y Larry.
Kenny, Lilly y Lee tratarán de mantener al grupo a salvo.
Tres meses después, está Mark, un hombre que tenía provisiones, pero en una semana, se las acabaron.
Lilly se preocupa de que no queden más recursos para todos.
Johns les ofrecen al grupo refugio y comida a cambio de combustible.
Johns tienen un trato con unos bandidos, el cual consiste en proveerles comida para evitar que los ataquen.
En el almacenamiento en donde los tienen encerrados, Larry sufre un infarto, por lo que Lee debe tomar la decisión de ayudar a Lilly para salvarlo o ayudar a Kenny aplastando la cabeza de Larry para prevenir que se transforme en zombi, aunque la decisión que tomes igualmente Kenny aplastará la cabeza de Larry.
Una semana más tarde, Lilly descubre que alguien ha estado entregándoles medicamentos a los bandidos, pero antes de que Lee pueda determinar quién es el culpable, tanto bandidos como zombis, atacan el Motel.
El grupo es forzado a escapar sin sus provisiones en un tráiler recién reparado, lugar en donde Kenny y Katjaa le revelan a Lee que Duck ha sido mordido durante el ataque.
En el camino, Katjaa revela que Duck está casi transformado debido a la mordida, y convence a Kenny para detener el tren y encargarse del niño.
Katjaa lleva a Duck hacia el interior de un bosque cercano, en donde se suicida.
Lee o Kenny matará a Duck para prevenir su transformación, dependiendo las decisiones del jugador, y continúan con su camino.
El grupo se refugia en una casa, Christa está muy preocupada por la herida de Omid.
El grupo se las arregla para entrar a la casa y revisar que todo esté despejado.
Kenny y Lee se dirigen al muelle, en donde descubren que no queda ningún bote en el lugar.
Vernon se ofrece a ir con Lee para examinar la pierna de Omid.
Una vez en Crawford encuentran que todos los habitantes se han transformado en zombis.
El grupo encuentra a Lee afuera y éste le muestra la mordida o no, dependiendo de las decisiones del jugador.
Consiguen llegar hacia la parte subterránea de la casa la cual no hay nada ni nadie, y se enciende el walkie-talkie, al cual el hombre responde que Clementine no fue secuestrada por Vernon.
Mientras trata de abrir un elevador Lee se desmaya debido a su mordida.
Lee o Clementine (dependiendo de las decisiones del jugador) matarán al hombre.
Demasiado débil para moverse por sí mismo y sabiendo que se convertiría en zombi muy pronto, instruye a la desconsolada Clementine para que lo espose a un radiador y de esta forma prevenir que él la pueda lastimar, también la instruye para tratar con un zombi que está en la tienda bloqueando las escaleras hacia el tejado, lugar en donde Clementine podría escapar para encontrar a Omid y a Christa.
Luego de los créditos finales del juego, se ve a Clementine caminando sola en un campo.
Estos 5 personajes (Bonnie, Shel, Russel, Vince y Wyatt) tienen una conexión dentro del juego.
La historia se situaba dos años después de los acontecimientos de la primera temporada, centrándose completamente en una Clementine que se veía forzada a madurar en un mundo cada vez más hostil y peligroso.